Институт по систематика и екология на животните от Сибирския клон на Руската академия на науките, Новосибирск, Русия

среда

Елена Н. Кашинская, Институт по систематика и екология на животните Сибирски клон на Руската академия на науките, ул. Фрунзе 11, Новосибирск 630091, Русия.

Институт по систематика и екология на животните от Сибирския клон на Руската академия на науките, Новосибирск, Русия

Сибирски федерален университет, Красноярск, Русия

Институт по химическа биология и фундаментална медицина, Сибирски клон на Руската академия на науките, Новосибирск, Русия

Институт по биология на вътрешните води на Папанин, Руска академия на науките, Борок, Некоузки район, Ярославска област, Русия

IRTA ‐ SCR, Сан Карлос де ла Рапита, Тарагона, Испания

Институт по систематика и екология на животните от Сибирския клон на Руската академия на науките, Новосибирск, Русия

Томски държавен университет, Томск, Русия

Институт по систематика и екология на животните от Сибирския клон на Руската академия на науките, Новосибирск, Русия

Елена Н. Кашинская, Институт по систематика и екология на животните Сибирски клон на Руската академия на науките, ул. Фрунзе 11, Новосибирск 630091, Русия.

Институт по систематика и екология на животните от Сибирския клон на Руската академия на науките, Новосибирск, Русия

Сибирски федерален университет, Красноярск, Русия

Институт по химическа биология и фундаментална медицина, Сибирски клон на Руската академия на науките, Новосибирск, Русия

Институт по биология на вътрешните води на Папанин, Руска академия на науките, Борок, Некоузки район, Ярославска област, Русия

IRTA ‐ SCR, Сан Карлос де ла Рапита, Тарагона, Испания

Институт по систематика и екология на животните от Сибирския клон на Руската академия на науките, Новосибирск, Русия

Томски държавен университет, Томск, Русия

Резюме

Целта на тази работа беше да се изследва микробното разнообразие на червата от осем вида диви риби с различни хранителни навици, храносмилателна физиология (стомашна срещу агастричен) и осигуряват сравнителен структурен анализ на микробните съобщества в тяхната среда (хранителни продукти, вода, утайки и макрофити).

Методи и резултати

Микробиотата на червата на рибите и техните жертви бяха изследвани с помощта на следващо поколение високопроизводително секвениране на 16S рибозомни РНК гени. Разпръснат график, базиран на резултатите от PCoA, демонстрира, че микробиотата формира три групи: (i) стомашна и чревна лигавица (IM), (ii) стомашно и чревно съдържание (IC) и (iii) плячка и околна среда. Сравненията, използващи ANOSIM, показаха значителни разлики между IC на всеядни, зообентивоядни, зоопланктиворно-рибоядни риби (P ≤ 0 · 1). Не е установена значителна разлика за лигавицата от същите групи (P > 0 · 1).

Заключения

Нито междувидовите разлики в диетата на рибите, нито тяхното филогенетично положение не са имали ефект върху микробиома на ИМ, но диетата е повлияла върху състава на микробиотата на ИК.

Значение и въздействие на изследването

Данните показват, че рибите са имали специфични групи бактерии, които не отразяват напълно микробиотата на околната среда или плячката.