Състояние Описание

Вроденото затлъстяване е прекомерното натрупване и съхранение на мазнини в тялото, което присъства по време на кърмаческа възраст и/или детството. Затлъстяването може да бъде диагностицирано като изолирана клинична находка или като част от синдромни находки. Моногенните форми на детското затлъстяване са много редки. Известно е, че мутациите само на няколко гена, контролиращи апетита и метаболизма, причиняват развитието на тежко затлъстяване в ранна детска възраст. EGL предлага тестване за синдромни и несиндромни едногенни причини за вродено затлъстяване; гените за предразположение и чувствителност не са включени в това тестване.

Анализ номер

Синдромните причини за вродено и рано настъпило затлъстяване в този панел включват:

  • Наследствена остеодистрофия на Олбрайт
  • Синдром на Alstrom
  • Синдром на Барде-Бидъл
  • Синдром на Borjeson-Forssman-Lehmann
  • Синдром на Коен
  • Синдром на Шааф-Ян (наричан още синдром на Прадер-Уили)
  • Недостиг на лептин
  • Дефицит на лептинов рецептор
  • Дефицит на MC4R (меланокортин 4 рецептор)

  1. Фаруки, И. Садаф и Стивън О'Рахили. „Синдром на генетичното затлъстяване“. Генетиката на затлъстяването. От Струан Ф. А. Грант. Ню Йорк: Spinger, 2014. 23-32. Печат.
  2. Goldstone AP, Beales PL. Генетични синдроми на затлъстяването. Изследване на границите на хормоните. 2008. 36: 37-60. doi: 10.1159/0000115336.
  3. Funcke J et al. Моногенни форми на детското затлъстяване поради мутации в лептиновия ген. Mol Cell Pediatr. 2014 дек; 1: 3.
  4. McLennan Y, et al. Крехък X синдром. Текуща геномика. 2011 май; 12 (3): 216-224.
  5. Налични са GeneReviews http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1116/.
  6. OrphaNet на разположение на http://www.orpha.net/.

Гени (29)

Показания

Тестът е показан за:

  • Лица с клинична или подозирана диагноза вродено затлъстяване.

Методология

Последователност от следващо поколение: Хибридизацията в разтвор на всички кодиращи екзони се извършва върху геномната ДНК на пациента. Въпреки че някои дълбоки интронични региони също могат да бъдат анализирани, този анализ не е предназначен да разпитва повечето промоторни региони, дълбоки интронични региони или други регулаторни елементи и не открива единични или мулти-екзонови делеции или дублирания. Директното секвениране на уловените региони се извършва с помощта на секвенция от следващо поколение. След това генните последователности на пациента се сравняват със стандартна референтна последователност. Потенциално причинно-следствените варианти и зоните с ниско покритие са секвенирани по Сангер. Вариациите на последователността са класифицирани като патогенни, вероятно патогенни, доброкачествени, вероятно доброкачествени или варианти с неизвестно значение. Варианти с неизвестно значение може да изискват допълнителни проучвания на пациента и/или членовете на семейството.

Анализ на номер на копие: Сравнителен анализ на дълбочината на четене (покритие) на NGS на целевите региони на гените в този панел беше извършен, за да се открият варианти на броя на копията (CNV). Точността на откритите варианти силно зависи от размера на събитието, контекста на последователността и покритието, получено за целевия регион. Поради тези променливи и ограничения не може да бъде определен минимално утвърден размер на CNV; обаче се очаква отделянето и дублирането на единични екзони да бъде под границата на откриване на този анализ.

Откриване

Последователност от следващо поколение: Клинична чувствителност: неизвестна. Мутации в промоторната област, някои мутации в интроните и други мутации на регулаторни елементи не могат да бъдат открити чрез този анализ. Резултатите от молекулярния анализ трябва да се интерпретират в контекста на клиничния/биохимичния фенотип на пациента.

Аналитичната чувствителност за откриване на вариант на последователност е

Анализ на номер на копие: Чувствителността и специфичността на този метод за откриване на CNV силно зависи от размера на събитието, контекста на последователността и дълбочината на покритие за съответния регион. Анализът е силно чувствителен за CNV от 500 базови двойки или по-големи и тези, съдържащи поне 3 екзона. По-малък (