Ежедневен сборник от научни статии за микробиоми, от екипа на доктора. Основана от Елизабет Бик, консултант по микробиом и научна цялост. Twitter: @microbiomdigest

февруари

Приятна сряда! След няколко дни бездействие, представяме този сборник с няколко рецензии от различни аспекти на изследванията на микробиомите. Включихме и някои статии за микробиота и резистентност към антибиотици, микробиота и метаболизъм и др.

Човешки и общ микробиом

Преглед: Микробиота и метаболизъм - Какво е новото през 2018 г. - Алексис Бретин - Американски вестник по физиология-ендокринология и метаболизъм

Преглед: Ейкозаноиди в GI тракта - John L Wallace - British Journal of Pharmacology

Рецензия: Микробиота на човешките черва в здравето и болестта на Алцхаймер - Leszek Szablewski - Journal of Alzheimer’s Disease

Профил на фекална микробиота при възрастни пациенти с атопична астма - A.M. Okba - европейски анали на алергията и клиничната имунология

Накратко: Микробиом: Принципи на присаждането на микробиота - Andrea Du Toit - Микробиология на отзивите на природата

Форум: Неадекватно производство на H2 от чревната микробиота и болестта на Паркинсон - Сергей М. Остоич - Тенденции в ендокринологията и метаболизма

Преглед: Вериги за хранене на мозъка след стомашен байпас на Roux-en-Y - Mohammed K.Hankir - Тенденции в ендокринологията и метаболизма

Животински микробиом

Патогенни изследвания

Преглед: Pseudomonas syringae: какво е необходимо, за да бъде патоген - Xiu-Fang Xin - Nature Reviews Microbiology

Хранителен микробиом

Воден микробиом

Екстремофили

Други документи

Днес над 100 сигнала с интересни статии във всяка категория. Някои акценти включват избор на донори на FMT, вирусни инсулиноподобни пептиди и 2 статии за откриване на дублирани фигури.

Общ микробиом
Преглед: Микробиомът в прецизната медицина: пътят напред. - Джоузеф Ф Петрозино - Геномна медицина

Мотивации на участниците в науката за микробиомиката на гражданите: данни от британския проект за червата. - Лоренцо Дел Савио - Генетика в медицината: Официален вестник на Американския колеж по медицинска генетика

Бременност и ранен живот
Ролята на пикочно-половия микробиом в детската урология: преглед. - Даниел Гербер - Текущи урологични доклади

Човешки микробиом на много места
Преглед: Блуждаещият нерв на границата на оста на микробиота-червата и мозъка. - Бруно Боназ - Frontiers In Neuroscience

Човешки вагинален микробиом
Съдържанието на протеин в цервиковагиналната течност се променя по време на бактериална вагиноза. - Каролина Санита Тафнер Ферейра - вестник за болестта на долните полови органи

Човешки почти стерилни сайтове
Взаимодействия между микробиом и домакин при получатели на трансплантация на хематопоетични стволови клетки. - Теса Андерман - Биология на трансплантацията на кръв и костен мозък: списание на Американското общество за трансплантация на кръв и костен мозък

Преглед: Човешка чревна микробиота и рак на стомашно-чревния тракт. - Changting Meng - Геномика, протеомика и биоинформатика

Преглед: Регулиране на здравето на червата чрез аминокиселини с разклонена верига. - Hua Zhou - Journal of Animal Science = Nihon Chikusan Gakkaiho

Глава на книгата: Термитен чревен микробиом - Navodita Maurice - Устойчивост в защитата на растенията и културите

Структурно разнообразие в арбускуларна микоризна, ектомикоризна и ендофитна растително-гъбична мрежа - Hirokazu Toju - bioRxiv

Изградена среда
Въвеждането на кучета променя микробиотата на домашния прах. - Александра Ситарик - Въздух в помещенията

Пробиотици/пребиотици/антибиотици
Жлъчно-солеви хидролази от пробиотичния щам - Thibault Allain - Граници в микробиологията

Фаги и вируси
** Вирусните инсулиноподобни пептиди активират човешки инсулин и IGF-1 рецепторна сигнализация: Промяна на парадигмата за взаимодействия гостоприемник и микроб. - Emrah Altindis - Известия на Националната академия на науките на Съединените американски щати

Геноми
Пълна последователност на генома и геномна характеристика на - Won-Hyong Chung - Граници във фармакологията

Този петък: Приятен набор от статии, фокусирани върху патогени като Salmonella и C. difficile, няколко статии за микробиома на почвата/корена и още ...

Човешки микробиом

Преглед: Кожна микробиота и човешки 3D модели на кожата - Franziska Rademacher - Експериментална дерматология

Акцент в изследванията: Колоректален рак: Бактериалните биофилми и токсини предизвикват перфектна буря за рак на дебелото черво - Iain Dickson - Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology

Акцент в изследванията: Метаболизъм: Тънкото черво - нов играч в метаболизма на фруктозата - Ивон Леонг - Ендокринология

Животински микробиом/Експерименти с животни

Човешки патогени

Хранителен микробиом

Растителни и екологични микробиоми

Микроби като цяло

Събития и работни места

Бременност и ранен живот

Микробиом на човешкото ухо, нос и гърло

Човешки орален микробиом

Човешки вагинален микробиом

Микробиом на човешките черва

Експерименти с животни

Животински микробиом

Вода и екстремофилен микробиом

Биоинформатика

Биотехнологии

Микроби в новините

Събития и работни места

BioData World West 2018 - 13-14 март - хотел Kabuki, Сан Франциско, Калифорния

Общ микробиом

[редакция] Системна биология на човешкия микробиом - BP Bernabé, L Cralle, JA Gilbert - Current Opinion in Biotechnology, 2018

Човешки репродуктивен или пикочен микробиом

Човешки дихателен микробиом

Микробиом на човешките черва

Животински микробиом

Микробиом на растения, корени и почви

Вода и екстремофилен микробиом

Хранителна микробиология

Фаги и вируси

Биоинформатика

Техники

Микроби в новините

Избори на Ед за немикробиология (можете да използвате собственото си име, разбира се!) (Готина наука за немикробиологията)

В днешния сборник можете да прочетете: за предимствата на атомно-силовата микроскопия при изучаване на орална микробиота в статията на S. S. Salavadhi; за чревната микробиомна връзка с диабет тип 1 в статията на J.A. Mullaney; за влиянието на стероидите върху чревната микробиота в рецензията на M.J Tetel и за способността на Synechococcus cyanobacteria да динамично променя съдържанието си на пигменти, за да съответства на цвета на околната светлина, в статията на T. Grébert. Това са, разбира се, само няколко от много интересни статии днес. Наслади се!

Събития и работни места

Общ микробиом

Рецензия: Ново парче в пъзела с микробиоми - Линдзи Дж. Пайк - Микробиология на отзивите на природата

Бременност и ранен живот

Човешки микробиом на много места

Орален микробиом

Микробиом на човешките черва

Преглед: Стероиди, стрес и чревна микробиома-мозъчна ос - M. J. Tetel - Journal of Neuroendocrinology

Експерименти с животни

Животински микробиом

Микробиом на растения, корени и почви

Вода и екстремофилен микробиом

Фаги и вируси

Микроби в новините

Събития и работни места

Общ микробиом

Назален микробиом

Бременност и ранен живот

Човешки вагинален микробиом

Микробиом на човешките черва

Микробиота: Миротворци за патобионти - Kirsty Minton, Nature Reviews Immunology

Орален микробиом

Експерименти с животни

Микробиота във ферментирали фуражи и свински черва - Cheng Wang, Приложна микробиология и биотехнологии

Животински микробиом

Микробиом на растения, корени и почви

Вода и екстремофилен микробиом

Хранителна микробиология

Пробиотици/Пребиотици

Биоинформатика

Техники

Немалко статии с предупреждения от днес и предния ден. Много интересни статии за взаимодействията между микроби и микроби и гостоприемници, насладете се!

Събития и работни места
Старши биоинформатик - Взаимодействия с микробиота домакин - Институт Sanger на Trust Trust

Председател на катедра - Катедра по микробиология и имунология - Колеж по ветеринарна медицина Университет Корнел, Итака, Ню Йорк

Човешки микробиом на много места
Диференциален принос на типове проби, култивиране и 16S - Lone Heimann Larsen - Journal Of Clinical Microbiology

Човешки орален микробиом
Бактериално микроизтичане на интерфейса абатмент-имплант, изследване in vitro. - Карлос Ларучеа - Клинична имплантация и свързани изследвания

Човешки вагинален микробиом
Преглед: Цервиковагинална микробиота и репродуктивно здраве: добродетелта на простотата. - Melis N Anahtar - Клетъчен домакин и микроб

Преглед: Терапии, базирани на чревна микробиота за синдром на раздразнените черва. - Емили К Стърн - Клинична и транслационна гастроентерология

Микробно-микробно/домакинско взаимодействие
Взаимодействията между хищничество и смущения оформят плячкосните общности. - Canan Karakoç - Научни доклади

Вода и екстремофилен микробиом
Състав и активност на микробни общности по редокс градиента на алкално, хиперсалиново, езеро. - Christian F Edwardson - Frontiers In Microbiology

Изградена среда
Течните ко-субстрати подсилват микробиомите на отпадъчните води - Justus Hardegen - bioRxiv

Пробиотици/пребиотици/антибиотици
Съотношение на концентрация на такролимус към доза при пациенти с трансплантация на твърди органи, лекувани с трансплантация на фекална микробиота за повтаряща се инфекция с Clostridium difficile. - Майкъл Х Удуърт - Трансплантационна инфекциозна болест: Официален вестник на Трансплантационното общество

Микроби в новините
Пътуване до „лабораторията на макарите“ в интерес на разработването на наркотици - Ерик Будман - STAT News

Честита лунна Нова година на кучето!

Today’s Digest съдържа много новини, а също така съдържа основна статия за проследяване на щама след трансплантация на фекална микробиота, преглед на антибактериалните протеини, оформящи чревната микробиота, и призив за действие за изграждане на общности за програмиране на биоинформатика.

Работни места

Обща микробиология

Глава на книгата: Агроиндустриални лигноцелулозни отпадъци: алтернатива за разгадаване на бъдещата биоенергия - Nidhi V. Maheshwari - Биогорива: смекчаване на емисиите на парникови газове и глобално затопляне

Микробиом на човешките черва

Преглед: Сборник от изследователския семинар на ASPEN за 2017 г. - Стомашен байпас: Роля на червата - Ajay Kumar Jain et al. - Списание за парентерално и ентерално хранене

* Антибактериално оръжие: целенасочено унищожаване на микробиотата - Беноа Шасинг и Ерик Каскалес - тенденции в микробиологията

Перспектива: Как да тренирате микробиома си да яде броколи - Сам Х. Ау - Научна транслационна медицина

Експерименти с животни

Животински микробиом

Микробиом на растения, корени и почви

Вода и екстремофилен микробиом

Хранителна микробиология

Фаги и вируси

Глава на книгата: Вируси, пренасяни от кърлежи и интерфейс на кожата на хоста - Mária Kazimírová et al. - Вектори на кожата и членестоногите

Технология

Микроби в новините

Микроби на пазара

Научна комуникация и образование

Особено интересна статия за инженерните бактерии при лечението на рак на дебелото черво днес: Chun Loong Ho и колегите са проектирали щам Е. coli, за да се свърже с раковите клетки на дебелото черво и да секретира по същество ензим, който може да превърне получените от храната глюкозинолати (от кръстоцветни зеленчуци) в рак борба с изотиоцинатите. Мишките, изложени на канцерогени и хранени както с инженерните бактерии, така и с броколи, развиват по-малко и по-малки колоректални тумори, отколкото изложени мишки, които са били хранени 1) нито с бактерии, нито с броколи, 2) само с бактерии или 3) само с броколи. Проектирани пробиотици за всеки?

Също така: Културна общност, разработена от отпадъчни води, която може да намали парниковия газ N2O до N2 и да помогне за смекчаване на глобалното затопляне; по-голямата част от микробиомите на дафния не се предават от родител на потомство, а се абсорбират от околната среда; и въздействието на натиска за подбор на CRISPR-Cas9 върху еволюцията на фага.