Резюме

Това е визуализация на абонаментното съдържание, влезте, за да проверите достъпа.

разкриват

Опции за достъп

Купете единична статия

Незабавен достъп до пълната статия PDF.

Изчисляването на данъка ще бъде финализирано по време на плащане.

Абонирайте се за списание

Незабавен онлайн достъп до всички издания от 2019 г. Абонаментът ще се подновява автоматично ежегодно.

Изчисляването на данъка ще бъде финализирано по време на плащане.

Препратки

Altschul SF, Gish W, Miller W et al (1990) Основен инструмент за търсене на локално подравняване. J Mol Biol 215: 403–410

Beal F (1915) Храна на робините и сините птици в САЩ. Бюлетин на биологичните изследвания на Министерството на земеделието на САЩ, том 171, стр. 151–175

Bohmann K, Monadjem A, Noer CL et al (2011) Анализ на молекулярната диета на два африкански прилепа без прилепи (Molossidae), използвайки последователност с висока производителност. PLoS ONE 6: e21441. doi: 10.1371/journal.pone.0021441

Bowles E, Schulte PM, Tollit DJ et al (2011) Пропорцията на консумираната плячка може да бъде определена от фекалната ДНК с помощта на PCR в реално време. Mol Ecol Resour 11: 530–540

Carlisle JD, Holberton RL (2006) Относителна ефективност на фекални спрямо регургитирани проби за оценка на диетата и вредните ефекти на повлияването на зъбен камък върху мигриращите птици. J Field Ornithol 77: 126–135. doi: 10.1111/j.1557-9263.2006.00032.x

Clare EL, Fraser EE, Braid HE et al (2009) Видове в менюто на хищник-генералист, източният червен прилеп (Lasiurus borealis): използване на молекулярен подход за откриване на плячка от членестоноги. Mol Ecol 18: 2532–2542. doi: 10.1111/j.1365-294X.2009.04184.x

Clare EL, Barber BR, Sweeney BW et al (2011) Места за хранене: влияния на местообитанието върху диетата на малките кафяви прилепи (Myotis lucifugus). Mol Ecol 20: 1772–1780. doi: 10.1111/j.1365-294X.2011.05040.x

Corse E, Costedoat C, Chappaz R et al (2010) PCR-базиран метод за анализ на диетата в сладководни организми, използващ 18S rDNA баркод върху фекалиите. Mol Ecol Resour 10: 96–108. doi: 10.1111/j.1755-0998.2009.02795.x

Deagle BE, Eveson JP, Jarman SN (2006) Количествено определяне на щетите в ДНК, възстановени от силно разградени проби - казус върху ДНК във фекалиите. Преден Zool 3:11

Deagle BE, Gales NJ, Evans K et al (2007) Изучаване на диетата на морските птици чрез генетичен анализ на фекалиите: казус върху макаронови пингвини (Eudyptes chrysolophus). PLOS ONE 2: e831. doi: 10.1371/journal.pone.0000831

Deagle BE, Kirkwood R, Jarman SN (2009) Анализ на диетата на австралийския тюлен чрез пиросеквенция на плячка ДНК във фекалиите. Mol Ecol 18: 2022–2038. doi: 10.1111/j.1365-294X.2009.04158.x

Deagle BE, Chiaradia A, McInnes J, Jarman SN (2010) Пиросеквенираща фекална ДНК за определяне на диетата на малките пингвини: какво става в това, което излиза? Conserv Genet 11: 2039–2048. doi: 10.1007/s10592-010-0096-6

Folmer O, Black M, Hoeh W et al (1994) ДНК праймери за амплификация на митохондриална цитохром с оксидазна субединица I от различни метазойни безгръбначни. Mol Mar Biol Biotech 3: 294–299

Guinan JA, Gowaty PA, Eltzroth EK (2008) Западна синя птица (Sialia mexicana). Птиците от Северна Америка онлайн. В: Poole A (ed) Ithaca: лаборатория по орнитология на Корнел; извлечено от птиците в Северна Америка онлайн: http://bna.birds.cornell.edu/bna/species/510. doi: 10.2173/bna.510

Howard E, Heiser J (2004) Какво има вътре: анатомия и физиология. В: Podulka S, Rohrbaugh R, Bonney R (eds) Cornell lab of ornithology’s handbook of bird biology, глава 4, 2-ро изд. Princeton University Press, Итака

Jarman SN, Gales NJ, Tierney M et al (2002) ДНК-базиран метод за идентификация на видовете крил и приложението му за анализ на диетата на морските гръбначни хищници. Mol Ecol 11: 2679–2690

King RA, Read DS, Traugott M, Symondson WOC (2008) Молекулярен анализ на хищничеството: преглед на най-добрите практики за ДНК-базирани подходи. Mol Ecol 17: 947–963. doi: 10.1111/j.1365-294X.2007.03613.x

Leonard ML, Teather KL, Horn AG et al (1994) Провизиите в Western Bluebirds не са свързани със секс на потомство. Behav Ecol 5: 455–459. doi: 10.1093/beheco/5.4.455

Levey DJ, Karasov WH (1992) Храносмилателна модулация при сезонно плодоядно, американския Робин (Turdus migratorius). Am J Physiol 262: G711 – G718

Levey DJ, Tewksbury JJ, Bolker BM (2008) Моделиране на разпръскване на семена на дълги разстояния в хетерогенни пейзажи. J Ecol 96: 599–608. doi: 10.1111/j.1365-2745.2008.01401.x

Mellott RS, Woods PE (1993) Подобрена техника на лигатура за вземане на диетични проби при гнездящи птици. J Field Ornithol 64: 205–210

Moody DT (1970) Метод за получаване на проби от храна от насекомоядни птици. Авк 87: 579

Murray DC, Bunce M, Cannell BL et al (2011) ДНК-базиран фекален диетичен анализ: сравнение на qPCR и подходите за последователност с висока производителност. PLoS ONE 6: e25776. doi: 10.1371/journal.pone.0025776

Neuweiler G (2000) Биологията на прилепите. Oxford University Press, Ню Йорк

Newsome SD, Del Rio CM, Bearhop S, Phillips DL (2007) Ниша за изотопна екология. Предна Ecol Environment 5: 429–436. doi: 10.1890/060150.01

Oehm J, Juen A, Nagiller K et al (2011) Молекулярна скатология: как да подобрим успеха на откриването на ДНК на плячка в птичи фекалии? Mol Ecol Resour 11: 620–628

Pompanon F, Deagle BE, Symondson WOC et al (2011) Кой какво яде: оценка на диетата с използване на последователност от следващо поколение. Мол Екол. doi: 10.1111/j.1365-294X.2011.05403.x

Razgour O, Clare EL, Zeale MRK et al (2011) Последователността с висока производителност предлага представа за механизмите на разделяне на ресурсите при криптични видове прилепи. Ecol Evol 1: 556–570. doi: 10.1002/ece3.49

Scupham A, Jones J, Wesley I (2007) Сравнение на методите за извличане на ДНК за анализ на микробиота от пуешки цекали. J Appl Microbiol 102: 401–409

Smith MA, Eveleigh ES, McCann KS et al (2011) Баркодиране на количествено определена хранителна мрежа: крипсис, концепции, екология и хипотези. PLOS ONE 6: e14424. doi: 10.1371/journal.pone.0014424

Symondson WOC (2002) Молекулярна идентификация на плячката при диети на хищници. Mol Ecol 11: 627–641

Valentini A, Miquel C, Nawaz MA et al (2009) Нови перспективи в анализа на диетата, базирани на ДНК баркодиране и паралелно пиросеквениране: подходът trnL. Mol Ecol Resour 9: 51–60. doi: 10.1111/j.1755-0998.2008.02352.x

Wilson JJ, Rougerie R, Schonfeld J et al (2011) Когато видовите съвпадения не са налични, правилно ли са присвоени баркодове на ДНК на по-високи таксони? оценка с помощта на сфингидни молци. BMC Ecol 11:18

Zeale MRK, Butlin RK, Barker GLA et al (2011) PCR, специфична за таксони, за ДНК баркодираща плячка на членестоноги във фекалиите на прилепи. Mol Ecol Resour 11: 236–244. doi: 10.1111/j.1755-0998.2010.02920.x

Благодарности

Националната научна фондация (DBI-1103583) и Калифорнийската университетска експериментална станция осигуриха финансиране за този проект. Благодарим на Рон Розенбранд, Даян Кенуърти, Робърт Бърни, Джоел Питърсън, Bedrock Vineyards и Spring Mountain Vineyards за достъп до гнездата на сините птици. Благодарим на Мари Лефевр за персонализирането на Perl скрипт за получаване на BLAST идентификации за последователности. Четирима анонимни рецензенти предоставиха полезни коментари за по-ранни версии на този ръкопис.

Информация за автора

Абхинет М. Шарма

Настоящ адрес: Медицинско училище, Университет Сейнт Луис, бул. Н. Гранд 221, Сейнт Луис, Мисури, 63103, САЩ

Принадлежности

Департамент по екологични науки, политика и управление, Калифорнийски университет, 130 Mulford Hall, Бъркли, Калифорния, 94720, САЩ

Julie A. Jedlicka, Abhineet M. Sharma & Rodrigo P. P. Almeida

Можете също да търсите този автор в PubMed Google Scholar

Можете също да търсите този автор в PubMed Google Scholar

Можете също да търсите този автор в PubMed Google Scholar