Статии Фигури и данни
Фигури
Сравнение на стратегиите за загуба и печалба на функцията InR (А) Стратегиите за загуба на мазнини и печалба на функциите се различават по етап и продължителност. (Вляво) Конститутивно активен InR се експресира по време на средата на третия етап чрез промотор за топлинен шок и се сравнява с InR в контролирани от топлинен шок див тип (yw -). Пробите, използвани за RNA-seq, се състоят от yw - или InR CA мастни тела, изолирани от ларви, които се хранят активно с контролни (5% захар) диети в продължение на 6 часа след топлинния шок. (Вдясно) InR загуба на функция се предизвиква от dsRNA (RNA i), изразена в мастното тяло през цялото развитие на ларвите при диета с 0.7 M захароза, в сравнение с водача на мазнини r4-GAL4, кръстосана с w 1118 контроли. Контролни или хронични InR i мастни тела са изолирани от блуждаещи ларви на трето ниво, когато животните могат да бъдат синхронизирани поради забавяне на развитието на r4-GAL4; UAS-InR i ларви (n = 3 за всеки генотип). (B) Припокриване между наборите от данни, генерирани от двете стратегии, т.е.общия набор от InR целеви гени, които сметнали за интерес за последващи проучвания. DAVID е използван за идентифициране на потенциално интересни гени и пътища в това припокриване.
Затихване на имунния отговор чрез хранене с HS. (А) Хемолимфа, изолирана от блуждаещи ларви на трето поколение, отгледани на 0,15 М захароза меланизира в рамките на 5 минути при стайна температура (вляво), докато малко цвят се наблюдава при 5-минутна хемолимфа, изолирана от ларви, отгледани на 1 М захароза (вдясно) . (Б) Седемдневна преживяемост на възрастни, отглеждани на 0,15 М или 1 М диети със захароза. Три до 7-дневни мухи от див тип (w 1118; r4-GAL4 трансхетерозиготни) мухи бяха заразени с полулетална доза Pseudomonas aeruginosa и оцеляването беше наблюдавано в продължение на 7 дни (n ≥ 23 флакона). (В) Седемдневна преживяемост на възрастни, отглеждани на 0,7 М диета със захароза. Три до 7-дневна контрола (w 1118; r4-GAL4 трансхетерозиготна) и InR i (r4-GAL4> UAS-InR i) преживяемост на мухата в продължение на 7 дни след инокулация с P. aeruginosa (n ≥ 19 флакона). Контролните мухи, убодени без P. aeruginosa, са показани в горната част на всяка графика (n ≥ 13 флакона за всеки). За извличане на P стойности беше използван двустранен тест на Student t. Лентите за грешки показват SEM.
Протеините за разпознаване на пептидогликан (PGRP) са нови регулатори на растежа след InR. (A) Намаляването на PGRP-SB2 в мастното тяло води до увеличаване на преживяемостта след отглеждане на 1 M диети със захароза HS в сравнение с контролите (r4-GAL4 пресича до линия номер 60100 контролни генетични мухи) (n ≥ 8 за всеки генотип). (B) Намаляването на PGRP-SB2 също увеличава размера на ларвите при зрялост в сравнение с контролите от див тип (n ≥ 15 за всеки генотип). (C) PGRP-SC2 RNAi в мастното тяло намалява преживяемостта на ларвите, отглеждани при 1 M диета със захароза HS (n ≥ 5 за всеки генотип). Поради високата степен на леталност на 1 M HS диети на тези животни, ние ги анализирахме на 0,7 M диети със захароза HS. (D) Размерът на ларвите се намалява от PGRP-SC2 RNAi на тялото с мазнини (n ≥ 15 за всеки генотип). За извличане на P стойности беше използван двустранен тест на Student t. Лентите за грешки показват SEM.
Промоторни елементи, общи за InR целевите гени. Топ 5 прогнозирани места бяха открити в рамките на предсказан промоторен регион (-700 до +100 по отношение на TSS) в гени с повишена експресия в InR i мастни тела и намалена експресия в InR CA мастни тела. Долните две консенсусни последователности са общи за промоторните области на гени с намалена експресия в InR i мастни тела и повишена експресия в InR CA мастни тела. Само първият сайт (GATGCCAGCTAA) се счита за силен и значим мач; останалите шест мотива са слабо обогатени.
Маси
Диференциална експресия в мастни тела, подложени на краткосрочно активиране на InR (InR CA) или хроничен InR нокдаун (InR i) a
| ER стрес | |||
| P58IPK | P58IPK | -2,56 | 1.98 |
| Ero1L | Ендоплазматичен ретикулум оксидоредуктин 1-подобен | -2,18 | 2.35 |
| Hsp70Bb | Протеин от топлинен шок 70Bb | 5.48 | 1.91 |
| Имунен отговор, антимикробни пептиди | |||
| Разл | Дорзален имунитетен фактор | -1,95 | 3.45 |
| AttA | Attacin-A | -4,65 | 5.37 |
| AttB | Attacin-B | −7,19 | 6.01 |
| IM3 | Имунно индуцирана молекула 3 | -3,26 | 377,90 |
| DptB | Диптерицин Б | −4,97 | 2.71 |
| CYP450 ензими | |||
| Cyp28a5 | Cyp28a5 | -2,56 | −2.03 |
| Cyp28d1 | Cyp28d1 | -2,55 | -1,60 |
| Cyp309a1 | Cyp309a1 | -3,37 | -2,79 |
| Cyp4d1 | Цитохром P450-4d1 | -2,53 | −3.06 |
| Cyp4d14 | Cyp4d14 | -2,38 | 1.97 |
| Cyp4g1 | Цитохром P450-4g1 | -2,75 | 2.40 |
| Cyp4p1 | Цитохром P450-4p1 | -3,68 | 1.98 |
| Cyp6a22 | Cyp6a22 | −3.03 | 3.08 |
| Cyp6d5 | Cyp6d5 | −2.02 | -2,12 |
| Cyp6t1 | Cyp6t1 | 5.25 | -3,21 |
| Cyp9b1 | Цитохром P450-9b1 | -3,36 | 2.68 |
| Cyt-b5-r | Свързан с цитохром b5 | -2,32 | -1,59 |
| Метаболитни ензими, обратно регулирани | |||
| IP3K2 | Инозитол 1,4,5-трифосфат киназа 2 | −2.04 | 1.76 |
| Odc2 | Орнитин декарбоксилаза 2 | -2,21 | 1.73 |
| Pdk | Пируват дехидрогеназа киназа | -1,91 | 1.61 |
| Acox57D-p | Ацил коензим А оксидаза | -2,01 | 2.00 |
| Ugt58Fa | UDP-глюкуронозилтрансфераза | −2.07 | 2.31 |
| Пепк | Фосфоенолпируват карбоксикиназа | -2,53 | 2.45 |
| ATPCL | АТФ цитратна лиаза | 1.77 | -1,87 |
| Fbp2 | Алкохолна дехидрогеназа | 15.53 | -1,83 |
| CG3394 | Преносим транспортер на мастни киселини | 2.06 | -2,45 |
| CG1969 | Глюкозамин-фосфатна N-ацетилтрансфераза 1 | 2.69 | -1,84 |
| CG30463 | Полипептид N-ацетилгалактозаминилтрансфераза | 2.33 | -2,22 |
| Метаболитни ензими, координирано регулирани | |||
| Sodh-1 | Сорбитол дехидрогеназа 1 | -2,67 | -28,65 |
| Tpi | Триозна фосфатна изомераза | −2.09 | −3.06 |
| Pgm | Фосфоглюконат мутаза | -2.08 | -2,23 |
| Изплю | Серин пируват аминотрансфераза | -2,13 | -2,36 |
| Разбрах2 | Глутамат/оксалоацетат трансаминаза 2 | -2,33 | -2,52 |
| Mdh2 | Малат дехидрогеназа 2 | -1,92 | -1,85 |
| Mdh1 | Малат дехидрогеназа 1 | -2,11 | -1,56 |
| Алд | Алдехид дехидрогеназа | -2,41 | -1,76 |
| AKHR | Адипокинетичен хормонален рецептор | -2,30 | 1.83 |
| Рибозома | |||
| RpL23 | Рибозомен протеин L23 | -1,84 | -1,62 |
| RpL24 | Рибозомен протеин L24 | -2,05 | -1,52 |
| RpLP2 | Рибозомен протеин LP2 | -2,10 | -2,26 |
| RpL4 | Рибозомен протеин L4 | −2.03 | 1,65 |
Target InR целеви гени в мастното тяло показват запазена биология между инсулинова резистентност към хора и мухи, включително ER стрес, имунен отговор, редокс биохимия, транслация и ключови метаболитни пътища.
Допълнителни файлове
Допълнителен материал
Фиг. S1 (Трансгенни PGRP RNAi фенотипи и роля на PGRP в инсулиновата сигнализация) и надписи към таблици S1 до S6
Таблица S1 (Диференциално експресирани гени в скитащи L3 мастни тела от ларви, отглеждани на контролни диети)
Таблица S2 (Диференциално експресирани гени в скитащи L3 мастни тела от ларви, отглеждани при диети с високо съдържание на захар)
Таблица S3 (Диференциално експресирани гени в мазнини от средата на третата възраст от ларви 6 часа след топлинен шок)
Таблица S4 (Диференциално експресирани гени в припокриване между HS InR i и InR CA мастни тела)
Таблица S5 (Имунни гени, експресирани диференциално при възрастни мъжки мухи, хранени с 0,15 M или 1 M храна в продължение на 4 седмици)
Таблица S6 (Имунни гени, диференцирано експресирани при възрастни мъжки мухи, хранени с 0,15 M или 1 M храна в продължение на 2 дни)
- Модел на мишка за индуцирано от диетата затлъстяване и инсулинова резистентност
- Всичко за инсулиновото прецизно хранене
- 30 начина да повишите метаболизма си през лятото, яжте това, а не онова!
- Раздяла с диети и излекувайте връзката си с храната ЗА ДОБРО
- Балансираната диета, дихателните упражнения и йога помогнаха за повишаване на имунитета на ченге, което се възстанови от Covid-19