Схема на метаре модули, които реализират петстепенна конвейерна линия за търсене на cis-елементи, значително свързани с диференциална генна експресия в множество набори от данни. DEG - диференциално експресирани гени. Различните модули са подчертани с квадратчета; крайните набори от p-стойности са боядисани в зелено. Описаните в методите стъпки са изброени на фигурата.

пълен

Cis-регулаторни елементи, предвидени с metaRE като систематично обогатени в горните регулаторни региони на гените, индуцирани от студ в Arabidopsis. (А) Анотация на хексамерите към известните места за свързване на Arabidopsis thaliana с помощта на инструмента TOMTOM [24]. Само значими най-добри съвпадения (E-стойност B) Подробности за анотацията за конкретни хексамери, свързани с ранни, късни или както ранни, така и късни отговори. Най-добрите значими съвпадения на хексамерите с известните места на свързване са свързани с понижаване на регулирането в отговор на студен стрес.