Резюме

Заден план

Синдромът на Wolf-Hirschhorn (WHS) е съседен генен синдром, причинен от частично 4p делеция, силно променлив по размер при отделни пациенти. Основният фенотип WHS се определя от връзката на забавяне на растежа, типични характеристики на лицето, интелектуални затруднения и гърчове. Критичният регион на WHS (WHSCR) е стеснен и NSD2 попада в този регион от 200 kb. Само четирима пациенти с NSD2 подробно са документирани варианти с фенотипни характеристики.

Представяне на дело

Тук докладваме случая на 12-годишно момче със закъснение в развитието. Той имаше дисморфични черти на лицето, включително широко разтворени очи, изпъкнал носен мост, продължаващ към челото, необичайни зъби и микрогнатия. Той също имаше лека клинодактилия на двете ръце. Използвайки секвениране на цели екзоми, ние идентифицирахме патогенна мутация в NSD2 [c.4029_4030insAA, p.Glu1344Lysfs * 49] изолиран от ДНК на периферна кръв. Потвърждението на Sanger за този вариант го разкри като de novo пресечен вариант в семейството.

Заключение

Тук съобщихме за момче с вариращ вариант de novo в NSD2 с нетипични клинични характеристики в сравнение с 4p16.3 WHS, свързани с делецията. Нашето откритие допълнително подкрепи патогенезата на отсечените варианти в NSD2 и очертаха възможния спектър от симптоми, причинени от тези варианти.

Заден план

Синдромът на Wolf-Hirschhorn (WHS) е описан за първи път през 1965 г. като вродени аномалии/умствена изостаналост поради частична делеция на р-терминала на хромозома 4 [1]. Пациентите с WHS (OMIM 194190) се характеризираха с черепно-лицеви черти, включително микроцефалия, външен вид на „гръцки воински шлем“ на широк носов мост, широко разположени и изпъкнали очи и отчетлива уста с обърнати надолу ъгли, къс филтрум и микрогнатия [2]. Други чести характеристики, наблюдавани при пациенти с WHS, са забавяне на вътрематочния растеж, дефицит на постнатален растеж, интелектуална недостатъчност, хипотония, гърчове, затруднения при храненето и мускулна хипотрофия [3]. В зависимост най-вече от степента на 4p делеция, допълнителни клинични признаци включват големи малформации, като дефекти по средната линия, вродени сърдечни дефекти, бъбречни и скелетни аномалии [4].

Припокриващите се области на множество случаи, диагностицирани с WHS, помогнаха да се реши критичният регион на WHS, а именно WHSCR1 и WHSCR2, който беше стеснен до 200 kb регион на 4p16.3 [5, 6]. Типичен WHS, дори и в лека форма на клиничния му фенотип, се приема до голяма степен като мултигенно разстройство. По този начин нито WHSCR, нито WHSCR-2 не са установени като категорична генетична причина за WHS, но те позволяват по-нататъшно изследване на възможни кандидат-гени. De novo вариация в NSD2 (също известен като WHSC1) се смята, че е свързан със заболявания, тъй като е идентифициран при пациенти с широк спектър от фенотипни характеристики, включително забавяне на развитието, аутизъм и вродени сърдечни нарушения. Последни съобщени случаи с включени de novo отрязващи варианти NSD2 и детайлни фенотипни характеристики предложиха нова представа за генетичните причини за WHS [7,8,9]. NSD2 се смята, че е основният, но не уникалният ген за лицеви дисморфизми, забавяне на растежа и интелектуални затруднения. Тук докладваме за момче с de novo вариант в NSD2 с атипични WHS клинични прояви, допълнително подкрепя патогенезата на отсечен вариант в NSD2 и очертаха възможния спектър на симптомите, причинени от тези варианти на един ген.

Представяне на дело

пресечен

Етично одобрение за това проучване е получено от комитета по етика на Шанхайския детски медицински център, Шанхайското училище по медицина Jiaotong. Писмено информирано съгласие за пусблиш е получено от родителите на пробанда.

Цялото екзоме на улавяне беше извършено с комплект за улавяне на обогатяване Agilent SureSelect V6 (Agilent Technologies, Inc., Woburn, MA, САЩ) в съответствие с инструкциите на производителя. След това уловената библиотека беше секвенирана на система Illumina HiSeq 2500 (Illumina, Inc., Сан Диего, Калифорния, САЩ). Данните за суровото секвениране бяха обработени, както беше описано по-горе [10]. Всички открити варианти бяха анализирани на платформата TGex (Translational Genomics Expert), включваща системата за точкуване VarElect [11]. Вариант на вмъкване c.4029_4030insAA, водещ до мутация на смяна на кадрите (p.Glu1344Lysfs * 49) на NSD2 е открит и се смята, че има голяма вероятност като кандидат-мутация.

Грундовете за усилване на NSD2 gen (NM_ 133,330.2) са проектирани с помощта на онлайн софтуера UCSC Exon Primer (http://genome.ucsc.edu/index.html) и синтезирани. Последователностите на грунда за потвърждаващия вариант, които трябва да бъдат потвърдени, бяха forward5’-agtttgtctgcccgtcctgt-3 ′ и обратни 5′-TGAGGATGGCTCAGTGGTG-3 ′.

Целевите фрагменти се амплифицират от пациентите, както и от родителите му, като се използва полимеразна верижна реакция (Takara Biotechnology, Co., Ltd., Dalian, China). PCR продуктите бяха секвенирани с помощта на ABI3730XL секвенсор (Applied Biosystems; Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, МА, САЩ) с прайвърите и реверсите. Данните за последователността са анализирани с помощта на софтуера Mutation Surveyor® Версия 4.0.4 (SoftGenetics, LLC). Отрязаният вариант е потвърден като de novo варианти в пробанда.

Дискусия и заключение

В заключение идентифицирахме вариант за отрязване de novo на NSD2 ген при пациент с лек фенотипен спектър на WHS, допълнително подкрепя патогенезата на нулеви варианти в NSD2 при синдромно интелектуално увреждане и забавяне на развитието и тези варианти водят до лека форма на WHS.

Наличност на данни и материали

Използваните и/или анализирани по време на текущото проучване набори от данни (секвениране на цели екзоми и файлове за секвенция на Сангер) са достъпни от съответния автор при разумна заявка.