Имената на авторите на членовете на LMAMR са показани в смело; съответното авторство е обозначено със звездичка (*).

публикации

Halffman CM, Potter BA, McKinney HJ, Tsutaya T, Finney BP, Kemp BM, Bartelink EJ, Wooller MJ, Buckley M, Clark CT, Johnson JJ, Bingham BL, Lanoë FB, Sattler RA и Reuther JD (2020) Древни берингски палеодиети, разкрити чрез многопрокси стабилни изотопни анализи. Научен напредък 6: eabc1968.

Kemp BM, Bingham B, Фром Р, Лабонте М, Палмър Е, Парсънс ES, Gobalet KW и Rosenthal J (2020) Потискане влиянието на PCR инхибиторите върху усилването на остаряла, деградирала и ниска бройка на ДНК: коктейл за подобряване на PCR и спасителна PCR. PLOS ONE 15: e0234745.

Бартън Л., Bingham B, Санкаранараянан К, Монро С, Томас А., и Kemp BM (2020) Най-ранните фермери от северозападния Китай експлоатираха зърнени фазани, а не пилета. Научни доклади 10: 2556.

Стефани Л. Шнор, Кортни А. Хофман, Shandukani R. Netshifhefhe, Frances D. Duncan, Танви П. Хонап, Джули Лесник и Сесил М. Луис (2019). Таксономични характеристики и сравнения на чревния микробиом от два термита, отглеждащи гъби за отглеждане (Macrotermes falciger; M. natalensis), събрана в квартал Vhembe в Лимпопо, Южна Африка. BMC микробиология. Том 19, брой 164. https://bmcmicrobiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12866-019-1540-5

Кортни Хофман и Кристина Warinner (2019). ДРЕВНА ДНК 101: ВЪВЕДЕНИЕ РЪКОВОДСТВО В ЕРАТА НА ПОСЛЕДОВАТЕЛСТВОТО С ВИСОКО ПРОХОД. Археологическият запис на SAA. Том 19, номер 1. http://cdn.coverstand.com/16146/563489/e4cef96f6b130ecb9d5682a3eae348c855c525f7.pdf

Рита М. Остин, Sabrina B. Sholts, LaShanda Williams, Logan Kistler и Кортни А. Хофман (2019). Мнение: За да курират молекулярното минало, музеите се нуждаят от внимателно обмислен набор от най-добри практики. PNAS. Том 116, брой 5. https://www.pnas.org/content/116/5/1471

Lindo, J., R. Haas, C.A. Хофман, М. Apata, M. Moraga, R. Verdugo, J.T. Watson, C. Viviano Llave, D. Witonsky, E. Vargas Pacheco, C. Beall, В. Warinner, J. Novembre, M. Aldenderfer, A. Di Rienzo (2018). Генетичната праистория на Андските планини 7000 години пр. Н. Е. Чрез европейски контакт. Научен напредък (4) 11. doi: 10.1126/sciadv.aau4921 http://advances.sciencemag.org/content/4/11/eaau4921

Патрик Липачевски, Йохана Хошидзаки, Уен-Уей Джанг, Лора-Изобел Маккол, Джон Торчивия-Родригес, Вахан Симонян, Аманпреет Каур, Кен Дюар, Грег Матлашевски (2018). Пълният референтен геном на Leishmania donovani идентифицира нови генетични вариации, свързани с вирулентността. Научни доклади Том 8, Номер на артикул: 16549. https://www.nature.com/articles/s41598-018-34812-x

Choongwon Jeong, Shevan Wilkin, Tsend Amgalantugs, Abigail S. Bouwman, William Timothy Treal Taylor, Ричард У. Хаган, SabriBromage, Soninkhishig Tsolmon, Christian Trachsel, Jonas Grossmann, Judith Littleton, Cheryl A. Makarewicz, John Krigbaum, Marta Burri, AshleyScott, Ganmaa Davaasambuu, Joshua Wright, Franziska Irmer, ErdeneMyagmar, Nicole Bobein, Martine Robbei, Бруно Фролих, Джесика Хенди, Кристина Warinner (2018). Динамика на популацията от бронзовата епоха и възходът на млекопроизводството в източната евразийска степ. Известия на Националната академия на науките. http://www.pnas.org/content/early/2018/10/31/1813608115

Палмър Е, Tushingham S, и Kemp BM (2018). Човешка употреба на дребни фуражни риби: Подобрените техники за идентифициране на древни ДНК видове разкриват дългосрочен опит за устойчиво масово събиране на риболов на топене в североизточната част на Тихия океан. Списание за археологически науки 99: 143-152.

Катрин Ашфорд, Raven Blankenship, Уайът Карпентър, Исак Уилър и Дъглас Гафин (2018). Отговор на източния пясъчен скорпион, Paruroctonus utahensis, за движение на въздух от аналог на молец. Списание за арахнология 46 (2). https://doi.org/10.1636/JoA-S-17-097.1

Кортни А. Хофман, Torben C. Rick, Jon M. Erlandson, Leslie Reeder-Myers, Andreanna J. Welch & Michael Buckley (2018). Колагенови пръстови отпечатъци и най-ранният лов на морски бозайници в Северна Америка. Научни доклади 8: 10014. https://doi.org/10.1038/s41598-018-28224-0

Джесика Хенди, Кристина Warinner, Абигейл Бауман, Матю Дж. Колинс, Сара Фидимент, Роман Фишер, Ричард Хаган, Кортни А. Хофман, Malin Holst, Eros Chaves, Lauren Klaus, Greger Larson, Meaghan Mackie, Krista McGrath, Amy Z. Mundorff, Anita Radini, Huiyun Rao, Christian Trachsel, Irina M. Velsko, Camilla F. Speller (2018). Протеомични доказателства за хранителни източници в древен зъбен камък. Proc. R. Soc. Б. 285 (1883). https://dx.doi.org/10.6084/m9.figshare.c.4150424.

Алисън Е. Ман, Сузана Сабин, Кирстен Циземер, Ошилд Й. Вагене, Ханес Шрьодер, Андрю Т. Озга, Критхивасан Санкаранараянан, Кортни А. Хофман, Джеймс А. Фелоуз Йейтс, Доминго С. Салазар-Гарсия, Бруно Фролих, Марк Алдендерфер, Мено Хугланд, Кристофър Рид, Джордж Р. Милнър, Ан С. Стоун, Сесил М. Луис-младши., Йоханес Краузе, Корин Хофман, Кирстен И. Бос и Кристина Warinner * (2018). Диференциално запазване на ендогенна човешка и микробна ДНК в зъбния камък и дентина. Научни доклади 8: 9822. https://doi.org/10.1038/s41598-018-28091-9

Джонсън BM, Kemp BM, и Thorgaard GH (2018). Увеличено митохондриално ДНК разнообразие в древен басейнов басейн на река Колумбия Чинук сьомга Oncorhynchus tshawytscha. PLoS One 13: e0190059.

Conrad C, Barceló LP, Seminoff JA, Tomaszewicz CT, Лабонте М, Kemp BM, Jones EL, Stoyka M, Bruner K и Pastron A (2018). Древен ДНК анализ и стабилна изотопна екология на морски костенурки (Cheloniidae) от ерата на Златната треска (1850-те) в източния Тихи океан. Отворено кватернерно 4: 1-13. http://doi.org/10.5334/oq.41

Knight R, Vrbanac A, Taylor BC, Aksenov A, Callewaert C, Debelius J, Gonzalez A, Kosciolek T, Маккол LI, McDonald D, Melnik AV, Morton JT, Navas J, Quinn RA, Sanders JG, Swafford AD, Thompson LR, Tripathi A, Xu ZZ, Zaneveld JR, Zhu Q, Caporaso JG, Dorrestein PC. Nat Rev Microbiol. 2018 май 23. doi: 10.1038/s41579-018-0029-9. PMID: 29795328

McCall L-I, Tripathi A, Vargas F, Knight R, Dorrestein PC, Siqueira-Neto JL (2018) Експериментални смущения, предизвикани от болестта на Chagas, на фекалните микробиоми и метаболоми. PLoS Negl Trop Dis 12 (3): e0006344. https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0006344

Honap TP, Pfister L-A, Housman G, Mills S, Tarara RP, Suzuki K, Cuozzo FP, Sauther ML, Rosenberg MS, Stone AC (2018) Геноми на Mycobacterium leprae от естествено заразени нечовешки примати. PLoS Negl Trop Dis 12 (1): e0006190. doi.org/10.1371/journal.pntd.0006190

Моралес-Арс, А. Й., C.A. Хофман, A. Duggan, M. A. Katzenberg, G. McCafferty, C. Warinner. Успешна реконструкция на цели митохондриални геноми от древна Централна Америка и Северозападно Мексико Научни доклади, (7) 18100. doi: 10.1038/s41598-017-18356-0

Shirazi, S., Rick, T.C., Erlandon, J.M., и Хофман, C.A. (2017) Приказка за две мишки: Транс-холоценов запис на Peromyscus nesodytes и Peromyscus maniculatus в пещерата Дейзи, остров Сан Мигел, Калифорния. Холоценът. doi.org/10.1177/0959683617744266

Бенджак А, Honap TP, Avanzi C, Becerril-Villanueva L, García I, Rojas-Espinosa O, Stone AC и Cole ST (2017). Прозрения от геномната последователност на Mycobacterium lepraemurium: масивен разпад на гените и редукционна еволюция. mBio 8: e01283-17

Kemp BM, Джъд К, Монро С, Eerkens JW, Hilldorfer LA, Cordray C, Schad R, Reams E, Ortman SG, Kohler TA. Праисторическата митохондриална ДНК на домашните животни подкрепя Изход от 13-ти век от северната част на Югозападната част на САЩ. 2017. PloS ONE 12 (7): e0178882

Маккол LI, Morton JT, Bernatchez JA, de Siqueira-Neto JL, Knight R, Dorrestein PC, McKerrow JH. Местоположение, местоположение, местоположение: пет факта за тъканния тропизъм и патогенеза. Anal Chem. 2017 3 октомври; 89 (19): 10414-10421. doi: 10.1021/acs.analchem.7b02423. Epub 2017 септември 22. PMID: 28892370

Velsko IM, Overmyer KA, Speller C, Loe L, Санкаранараянан К, Колинс М, Луис CM, Баутиста Родригес J, Chaves E, Coon JJ, Larson G, Warinner C*. 2017. Метаболомът на зъбния камък в съвременни и исторически проби. Метаболомика 13: 134

Warinner C, Хенди Дж. 2017. Древни култури: Археологията на млечните продукти и трайното наследство на микробите от „наследство“. Mælkeritidende 21: 10-11.

Warinner C, Herbig A, Man AE, Fellows Yates JA, Weiss CL, Burbano HA, Orlando L, Krause J. (2017) Здрава рамка за микробна археология. Ану. Преподобен геном. Хъм. Genet., В пресата. http://www.annualreviews.org/doi/abs/10.1146/annurev-genom-091416-035526

Велско I, Warinner C *. (2017) Биоархеология на човешкия микробиом. Bioarchaeology International, в пресата.

Lindo J, Achilli A, Perego U, Archer D, Valdiosera C, Petzelt B, Mitchell J, Worl R, Dixon EJ, Fifield T, Rasmussen M, Willerslev E, Cybulski J, Kemp BM *, DeGiorgio M и Malhi RS. (2017) Древните индивиди от северноамериканското северозападно крайбрежие разкриват 10 000 години регионална генетична приемственост. Известия на Националната академия на науките САЩ, в пресата.

Winters M, Monroe C, Barta JL и Kemp BM *. (2017) Ловим ли или ловим? Оценка на ефективността на улавянето на стръв от фрагменти CODIS. Forensic Science International: Генетика, в пресата.

Bouwman A, Shved N, Akgül G, Rühli F, Warinner C *. (2017) Древното разследване на ДНК на средновековно немско гробище потвърждава дългосрочната стабилност на честотите на алелите CCR5-∆32 в Централна Европа. Човешка биология, в пресата.

Джонсън Б и Kemp BM. (2017) Rescue PCR: Богатата на реагенти PCR рецепта подобрява амплификацията на разградените ДНК екстракти. Списание за археологически науки: Доклади 11: 683-694

Олсен К, бял CD, Longstaffe FJ, Rühli FJ, Warinner C, и Салазар-Гарсия, окръг Колумбия. (2017) Изотопна антропология на немската средновековна диета в селските райони: вътрешно- и междупопулационна променливост. Археологически и антропологични науки, под печат. doi: 10.1007/s12520-016-0432-y

Schnorr S, Sankaranarayanan K, Lewis CM, Warinner C*. (2016) Прозрения в човешката еволюция от древни и съвременни изследвания на микробиоми. Текущо мнение в областта на генетиката и развитието 41: 14-26.

Warinner C. (2016) Зъбен камък и еволюция на човешкия орален микробиом. Вестник на Калифорнийската стоматологична асоциация 44 (7): 411-420.

Jeong C, Ozga AT, Witonsky D, Malmstrom H, Edlund H, Хофман Калифорния, Hagan RW, Якобсон М, Луис CM, Алдендерфер М, Ди Риенцо А, Warinner C*. (2016) Дългосрочна генетична стабилност и голяма надморска височина източноазиатски произход за народите от високите долини на Хималайската дъга. Известия на Националната академия на науките САЩ 113 (27): 7485-7490.

Patel N, Тито Р, Обрегон-Тито А, O’Neal L, Трухийо-Вилароел О, Марин-Рейес L, Troncoso-Corzo L, Guija-Poma E, Луис CM, Лоусън ПА * (2016) Peptoniphilus catoniae sp. нов., изолиран от човешка фекална проба от традиционна перуанска крайбрежна общност. Международен вестник за систематична и еволюционна микробиология 66: 2019-2024.

Маккол LI, Siqueira-Neto JL, McKerrow JH. PLoS Pathog. 2016 г. 26 май; 12 (5): e1005519. doi: 10.1371/journal.ppat.1005519. eCollection 2016 май.

Petras D, Nothias LF, Quinn RA, Alexandrov T, Bandeira N, Bouslimani A, Castro-Falcón G, Chen L, Dang T, Floros DJ, Hook V, Garg N, Hoffner N, Jiang Y, Kapono CA, Koester I, Knight R, Leber CA, Ling TJ, Luzzatto-Knaan T, Маккол LI, McGrath AP, Meehan MJ, Merritt JK, Mills RH, Morton J, Podvin S, Protsyuk I, Purdy T, Satterfield K, Searles S, Shah S, Shires S, Steffen D, White M, Todoric J, Tuttle R, Wojnicz A, Sapp V, Vargas F, Yang J, Zhang C, Dorrestein PC. Anal Chem. 2016 г. 15 ноември; 88 (22): 10775-10784. Epub 2016 24 октомври.

Ozga AT, Nieves-Colón MA, Honap T, Санкаранараянан К, Хофман С, Milner G, Луис CM, Камък AC, Warinner C *. (2016) Успешно обогатяване и възстановяване на цели митохондриални геноми от древен човешки зъбен камък. Американски вестник по физическа антропология 160: 220-228.

Ozga AT, Санкаранараянан К, Тито RY, Обрегон-Тито AJ, Фостър М, Tallbull G, Спайсър П, Warinner C, Луис-младши. СМ. Орално охарактеризиране на микробиоми на индивидите от Шайен и Арапахо от Оклахома. Американско списание за физическа антропология, в пресата. doi: 10.1002/ajpa.23033

Patel N, Тито Р, Обрегон-Тито А, O’Neal L, Трухийо-Вилароел О, Марин-Рейес Л, Тронкозо-Корцо Л, Гиджа-Пома Е, Луис CM, Лоусън ПА * (2016) Peptoniphilus catoniae sp. ноември, изолиран от човешка фекална проба от традиционна перуанска крайбрежна общност. Международен вестник за систематична и еволюционна микробиология 66: 2019-2024.

Мелиса Е Бел, Катрин А Бърнард, Сюзън М. Харингтън, Ниша Б П.ател, Trudy-Ann Tucker, Maureen G Metcalfe, John R McQuiston (2016) Lawsonella clevelandensis gen. ноември., sp. ноември, нов член на подреда Corynebacterineae, изолиран от човешки абсцеси. Международно списание за систематична и еволюционна микробиология

КНИГИ И ГЛАВИ НА КНИГИТЕ

Marston JM, d’Alpoim Guedes J, Warinner C, изд. Метод и теория в палеоетноботаниката. University Press в Колорадо, 2014. Налично за поръчка тук.

Хюстън S, Бритънъм C, Mesick C, Tokovinine A и Warinner C. Забулена яркост: История на древния цвят на маите. Остин: Университет на Тексас, 2009 г. Налично за поръчка тук.

Warinner C и d’Alpoim Guedes J. Дигитализиране на археоботаническия запис. В: Marston JM, d’Alpoim Guedes J, Warinner C, изд. Метод и теория в палеоетноботаниката. University Press на Колорадо Боулдър, 2014. Налично за поръчка тук.

Warinner C. От нулата: напредък в стабилното палеодиетично заключение, основано на изотопи. Marston JM, d’Alpoim Guedes J, Warinner C, изд. Метод и теория в палеоетноботаниката. Университетска преса в Колорадо, Боулдър, 2014.

Marston, JM, d’Alpoim Guedes J и Warinner C. „Палеоетноботаничен метод и теория през 21 век“, в Marston JM, d’Alpoim Guedes J, и Warinner C, eds. Метод и теория в палеоетноботаниката. Университетска преса в Колорадо, Боулдър, 2014.

Warinner C и Tuross N. „Древен анализ на ДНК и стабилен изотоп на гробището Teposcolula Grand Plaza“, в Нели Роблес-Гарсия, изд. Yucundaa: La cuidad mixteca Yucundaa-Pueblo Viejo de Teposcolula y su transformación prehispánica-colonial. Instituto Nacional de Antropología e Historia, в пресата.

Tuross N, Warinner C, и Robles Garcia N. „Доказателства за взаимодействието на Mixtec/Доминикан от радиовъглеродните дати в Yucundaa (Pueblo Viejo de Teposcolula)“, в Nelly Robles-García, изд. Yucundaa: La cuidad mixteca Yucundaa-Pueblo Viejo de Teposcolula y su transformación prehispánica-colonial. Instituto Nacional de Antropología e Historia, в пресата.

Луис, CM, младши и TA Tung. Съображения при вземане на проби от човешки остеологични останки. В Мъртвите разказват приказки: Есета в чест на Джейн Е. Буйкстра, редактиран от Б. Ó. Donnabháin и M. C. Lozada. Институт по археология Cotsen, UCLA, Лос Анджелис, Калифорния, 2013.

Луис С., Спайсър Р, Проучване на човешки микробиоми и местни общности, проект. (2012) В: Nelson K. (Ed.) Encyclopedia of Metagenomics: SpringerReference. Springer-Verlag Берлин Хайделберг.

Лонг, JC, N Скот и CM Lewis, Jr., Раса, генетика, в здравеопазването. (2007) В Енциклопедия на расата и расизма. Джон Мур изд. Справка за библиотеката на Macmillan.