Учени от Центъра за науки за живота на Сколтех (CLS) и техните колеги от Висшето училище по икономика (HSE), Изследователския институт по грип Смородинцев (СПИ) в Санкт Петербург и Института на Харкевич за проблемите на предаването на информация от РАН в Москва предприе първото проучване на геномната епидемиология на COVID-19 в Русия. Изследователите извършиха генетичен анализ на 211 вирусни проби, взети от пациенти в Русия между 11 март и 23 април. Техните открития потвърждават предположението, че COVID-19 е проникнал в Русия от Европа в края на февруари и началото на март.

covid-19

В момента Русия се нарежда на четвърто място в света по брой случаи на COVID-19, въпреки че огнището настъпва в Русия по-късно, отколкото в много съседни страни. Възможна причина е, че Русия рано е затворила границата си с Китай. Само чрез генетичен анализ на вирусни проби може да се получат точни данни за разпространението на вируса и ефективността на различни методи за контрол на инфекцията. Вирусите мутират бързо, така че чрез изучаване на вирусни мутации и сравняване на вирусни геномни последователности може да се възстанови еволюцията и разпространението на вируса в популация.

Група изследователи от Skoltech CLS, HSE RII и IITP RAS, водени от Георги Базикин, професор в Skoltech, разгледаха модела на разпространение на COVID-19 в Русия в ранните етапи на пандемията. Комбинирайки генетични данни за щамовете, циркулиращи в Русия, с данни за историята на пътуванията, учените стигнаха до заключението, че вирусното разнообразие на Русия е резултат от най-малко 67 различни вноса на вируси в различни руски градове в края на февруари и началото на март. Установено е, че за разлика от много други страни, Русия е получила своя вирус от Европа, а не от Китай. Важното е, че много от ранните вносни случаи на COVID-19 не доведоха до предаване в Русия. Въпреки това, поне девет различни коронавирусни щама, които в момента циркулират в Русия, не са срещани никъде другаде. Отделен анализ се отнася до голямото огнище на COVID-19 в руския изследователски институт по травматология и ортопедия Vreden в Санкт Петербург, където над 400 души са се заразили в болницата на института. Установено е, че вирусният щам на болница Vreden впоследствие се е разпрострял над Санкт Петербург, допринасяйки за цялостната епидемиологична ситуация в града.

"Не става въпрос само за историята; геномната епидемиология също помага да се интерпретират бъдещи събития. Например, представете си, че Русия отваря границите си и броят на случаите започва да нараства. Това съвпадение ли е, или тези случаи произхождат от ново внесен вирус? Чрез сравнение геномите на нови и стари вируси, ще можем да кажем “, обяснява професор Базикин.

Повече информация: Андрей Б Комисаров и др. Геномна епидемиология на ранните етапи на огнище на SARS-CoV-2 в Русия, (2020). DOI: 10.1101/2020.07.14.20150979