Субекти

Резюме

Анализът на непокътнати протеинови възли в естествени подобни състояния чрез масова спектрометрия предлага богата информация за техните биохимични и биофизични свойства. Тук показваме, че анализаторът на маса Orbitrap може да се използва за измерване на протеинови възли с молекулни тегла, приближаващи се до един мегадалтон с чувствителност до откриване на единични йони. Незначителни инструментални модификации позволиха измерването на различни протеинови възли с изключителна масова спектрална разделителна способност.

Опции за достъп

Абонирайте се за Journal

Получете пълен достъп до дневник за 1 година

само 4,60 € на брой

Всички цени са нетни цени.
ДДС ще бъде добавен по-късно при плащане.

Наем или покупка на статия

Получете ограничен или пълен достъп до статии в ReadCube.

Всички цени са нетни цени.

високочувствителен

Препратки

Шарън, М. и Робинсън, C.V. Ану. Rev. Biochem. 76, 167–193 (2007).

По дяволите, A.J. Нат. Методи 5, 927–933 (2008).

Обущар, Г.К. и др. Мол. Клетка. Протеомика 9, 1742–1751 (2010).

Sobott, F., Hernandez, H., McCammon, M.G., Tito, M.A. & Robinson, C.V. Анален. Chem. 74, 1402–1407 (2002).

van den Heuvel, R.H. et al. Анален. Chem. 78, 7473–7483 (2006).

Христос, П. и сътр. Евро. J. Mass Spectrom. (Чичестър, англ.) 10, 469–476 (2004).

Чернушевич, И.В. & Thomson, B.A. Анален. Chem. 76, 1754–1760 (2004).

Zhang, Z., Pan, H. & Chen, X. Mass Spectrom. Преп. 28, 147–176 (2009).

Perry, R.H., Cooks, R.G. & Noll, R.J. Mass Spectrom. Преп. 27, 661–699 (2008).

Hendrix, R. W. & Johnson, J. E. Adv. Опит Med. Biol. 726, 351–363 (2012).

Bochtler, M., Ditzel, L., Groll, M., Hartmann, C. & Huber, R. Ану. Преподобна Biophys. Biomol. Структура. 28, 295–317 (1999).

Кришна, К.А., Рао, Г.В. & Rao, K.R. Curr. Протеин Pept. Sci. 8, 418–425 (2007).

Ростом, А.А. и др. Proc. Natl. Акад. Sci. САЩ 97, 5185–5190 (2000).

Tito, M.A., Tars, K., Valegard, K., Hadju, J. & Robinson, C.V. J. Am. Chem. Soc. 122, 3550–3551 (2000).

Макаров, А. и Денисов, Е. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 20., 1486–1495 (2009).

Benesch, J. L., Aquilina, J. A., Ruotolo, B. T., Sobott, F. & Robinson, C.V. Chem. Biol. 13, 597–605 (2006).

Монти, М.К. и др. Нуклеинови киселини Res. 39, 8052–8064 (2011).

Rogniaux, H. et al. Анален. Biochem. 291, 48–61 (2001).

Zhou, M. et al. Наука 334, 380–385 (2011).

Cui, W., Rohrs, H.W. & Gross, M.L. Аналитик (Лондон) 136, 3854–3864 (2011).

Quaite-Randall, E. & Joachimiak, A. Методи Mol. Biol. 140, 29–39 (2000).

Olsen, J.V. et al. Мол. Клетка. Протеомика 8, 2759–2769 (2009).

Михалски, А. и др. Мол. Клетка. Протеомика 10, M111.011015 (2011).

Макаров, А. Анален. Chem. 72, 1156–1162 (2000).

Благодарности

Тази работа беше подкрепена отчасти от проекта PRIME-XS, Споразумение за безвъзмездна помощ номер 262067 и от мрежата PROSPECTS (безвъзмездна финансова помощ ЗДРАВЕ-F4-2008-201648), финансирана от Седмата рамкова програма на Европейския съюз. Холандският протеомичен център, вграден в холандската инициатива за геномика, е признат за финансиране. Авторите благодарят на Майкъл Грьол (Technische Universitat Munchen) за доброто му дарение на 20S протеазомна проба, Джак Джонсън (Scripps Research Institute) за пробата на капсумата HK97, Genmab за IgG антителата и Уве Рикенс (Thermo Fisher Scientific) за разработването на IonDetectionConverter софтуер за експерименти с единични йони.

Информация за автора

Принадлежности

Биомолекулна масова спектрометрия и протеомика, Бижвоет Център за биомолекулярни изследвания и Институт по фармацевтични науки в Утрехт, Университет Утрехт, Утрехт, Холандия

Rebecca J Rose & Albert J R Heck

Холандски протеомичен център, Утрехт, Холандия

Rebecca J Rose & Albert J R Heck

Thermo Fisher Scientific (Бремен), Бремен, Германия

Ойген Дамок, Едуард Денисов и Александър Макаров

Можете също да търсите този автор в PubMed Google Scholar

Можете също да търсите този автор в PubMed Google Scholar

Можете също да търсите този автор в PubMed Google Scholar

Можете също да търсите този автор в PubMed Google Scholar

Можете също да търсите този автор в PubMed Google Scholar

Вноски

R.J.R., E.Da., E.De., A.M. и A.J.R.H. извърши експериментите и написа ръкописа. А.М. контролираше модификациите на анализатора на масата Orbitrap. А.М. и A.J.R.H. концептуално проектира произведението.

Автора за кореспонденция

Етични декларации

Конкуриращи се интереси

E.Da., E.De. и А.М. са служители на Thermo Fisher Scientific, производител на инструмента Exactive Plus, използван в това изследване.

Допълнителна информация

Допълнителен текст и фигури

Допълнителни фигури 1–10 (PDF 950 kb)

Права и разрешения

Относно тази статия

Цитирайте тази статия

Роуз, Р., Дамок, Е., Денисов, Е. и др. Анализ на масата на Orbitrap с висока чувствителност на непокътнати макромолекулни възли. Методи Nat 9, 1084–1086 (2012). https://doi.org/10.1038/nmeth.2208

Получено: 20 юни 2012 г.

Приет: 17 септември 2012 г.

Публикувано: 14 октомври 2012 г.

Дата на издаване: ноември 2012 г.

Допълнителна информация

Модулните детергенти приспособяват пречистването и структурния анализ на мембранните протеини, включително G-протеинови рецептори

  • Леонхард Х. Урнер
  • , Идлир Лико
  • , Hsin-Yung Yen
  • , Кин-Куан Хой
  • , Джани Реди Бола
  • , Джоузеф Голт
  • , Фернандо Гонсалвес Алмейда
  • , Марк-Филип Шведър
  • , Денис Шутин
  • , Свеня Ерман
  • , Райнер Хааг
  • , Карол В. Робинсън
  • & Кевин Пейдж

Nature Communications (2020)

Последни постижения в LC-MS характеристика на протеино-базирана биотерапия - овладяване на аналитичните предизвикателства, породени от нарастващата сложност на формата

  • Тобиас Граф
  • , Катрин Хайнрих
  • , Ингрид Грунерт
  • , Харалд Вегеле
  • , Маркус Хабергер
  • , Патрик Булау
  • & Майкъл Лайс

Списание за фармацевтичен и биомедицински анализ (2020)

Масспектрометрично откриване и характеризиране на метаболити на повърхностноактивни вещества от Близнаци, използвани като вектори за доставка на гени

  • Уей Джин
  • , Ранди Първс
  • , Ед Крол
  • , Илдико Бадеа
  • & Анас Ел-Анид

Вестник на Американското общество за масова спектрометрия (2020)

Бърз онлайн онлайн буферен обмен за скрининг на протеини, протеинови комплекси и клетъчни лизати чрез нативна масова спектрометрия

  • Захари Л. ВанАрнум
  • , Флориан Буш
  • , Бенджамин Дж. Джоунс
  • , Mengxuan Jia
  • , Zibo Chen
  • , Скот Е. Бойкен
  • , Анирудха Сахасрабудхе
  • , Дейвид Бейкър
  • & Вики Х. Висоцки

Протоколи за природата (2020)

Анализ на високи маси с мас-спектрометър на йонна циклотронна резонансна трансформация на трансформацията на Фурие: от неорганични клъстери на сол до конюгати на антитела и след това

  • Iain D. G. Campuzano
  • , Майкъл Ншанян
  • , Кристофър Спар
  • , Картър Ланц
  • , Чавита Нетироджанакул
  • , Хуйлин Ли
  • , Пирия Вонгконгкатеп
  • , Джеръми Дж. Улф
  • & Джоузеф А. Лоо

Вестник на Американското общество за масова спектрометрия (2020)