Резюме на основните категории и подкатегории на пътищата на Киото енциклопедия на гени и геноми (KEGG) като резултати от транскриптомния ефект върху тъканите на млечната жлеза (M) и черния дроб (L) на царевичния кормил (CS) в сравнение със смесения фураж (MF) съотношението при млечните крави, анализирано от подхода на динамичното въздействие. Вдясно са лентата, обозначаваща общото въздействие (в синьо) и сянката, обозначаваща ефекта върху пътя (от зелено - инхибирано - до червено - активирано). По-тъмният цвят е по-голям при активирането (ако е червено) или инхибирането (ако е зелено) на пътя.

10-те най-засегнати пътища в черния дроб (CS/MF черен дроб), млечните жлези (CS/MF Mammary) и като цяло в черния дроб и млечната жлеза (CS/MF) на царевичния кормил (CS) в сравнение с дажбата на смесен фураж (MF) при млечните крави разкрити от подхода на динамичното въздействие. Вдясно са лентата, обозначаваща общото въздействие (в синьо) и сянката, обозначаваща ефекта върху пътя (от зелено - инхибирано - до червено - активирано). По-тъмен цвят е по-голям активирането (ако е червено) или инхибирането (ако е зелено) на пътя.

Резултати от функционален анализ, разкрити от анализ на база данни за анотации, визуализация и интегрирано откриване (DAVID) на преписите нагоре (в червен нюанс на фигурата) или надолу (в син нюанс на фигурата), регулирани от царевичен стовар (CS) в сравнение до смесен фураж (MF) както в черния дроб, така и в млечната жлеза (CS/MF), само в чернодробната тъкан (CS/MF черен дроб) или само в млечната тъкан (CS/MF Mammary). GO_MF: Молекулярна функция на генната онтология; GO_CC: Клетъчен компонент на генната онтология; GO_BP: Биологичен процес на генната онтология; KEGG: Киото енциклопедия на гени и геноми.

Функционална анотация за черния дроб и млечната жлеза в CS (царевичен плот) в сравнение с MF (смесен фураж), разкрита от ClueGO. Показани са обогатените термини в DEG между CS срещу MF. По-специално: (A) регулиран надолу DEG в черния дроб; (B) регулиран нагоре DEG в черния дроб; С: DEG-регулиран DEG в млечната тъкан; (D) регулиран нагоре DEG в млечната тъкан. Размерът на възлите отразява статистическата значимост на всеки термин. По-голям размер на възела, по-малка P-стойност. Името на всяка група се дава от най-значимия термин/път на групата. Възлите са групирани по сходство на свързаните с тях гени. Възлите в шестоъгълник представляват условията на GO Cellular Component; възлите в осмоъгълника представляват условията на GO молекулярна функция; възлите в правоъгълник представлява пътя на KEGG. Малките кръгове със символи в червен шрифт представляват гените, свързани със съответните термини или пътища.

Просто обобщение

Резюме

животни

Резюме на основните категории и подкатегории на пътищата на Киото енциклопедия на гени и геноми (KEGG) като резултати от транскриптомния ефект върху тъканите на млечната жлеза (M) и черния дроб (L) на царевичния кормил (CS) в сравнение със смесения фураж (MF) съотношението при млечните крави, анализирано от подхода на динамичното въздействие. Вдясно са лентата, обозначаваща общото въздействие (в синьо) и сянката, обозначаваща ефекта върху пътя (от зелено - инхибирано - до червено - активирано). По-тъмният цвят е по-голям при активирането (ако е червено) или инхибирането (ако е зелено) на пътя.

10-те най-засегнати пътища в черния дроб (CS/MF черен дроб), млечните жлези (CS/MF Mammary) и като цяло в черния дроб и млечната жлеза (CS/MF) на царевичния кормил (CS) в сравнение с дажбата на смесен фураж (MF) при млечните крави разкрити от подхода на динамичното въздействие. Вдясно са лентата, обозначаваща общото въздействие (в синьо) и сянката, обозначаваща ефекта върху пътя (от зелено - инхибирано - до червено - активирано). По-тъмният цвят е по-голям при активирането (ако е червено) или инхибирането (ако е зелено) на пътя.

Резултати от функционален анализ, разкрити от анализ на база данни за анотации, визуализация и интегрирано откриване (DAVID) на преписите нагоре (в червен нюанс на фигурата) или надолу (в син нюанс на фигурата), регулирани от царевичен стовар (CS) в сравнение до смесен фураж (MF) както в черния дроб, така и в млечната жлеза (CS/MF), само в чернодробната тъкан (CS/MF черен дроб) или само в млечната тъкан (CS/MF Mammary). GO_MF: Молекулярна функция на генната онтология; GO_CC: Клетъчен компонент на генната онтология; GO_BP: Биологичен процес на генната онтология; KEGG: Киото енциклопедия на гени и геноми.

Функционална анотация за черния дроб и млечната жлеза в CS (царевичен плот) в сравнение с MF (смесен фураж), разкрита от ClueGO. Показани са обогатените термини в DEG между CS срещу MF. По-специално: (A) регулиран надолу DEG в черния дроб; (B) регулиран нагоре DEG в черния дроб; С: DEG-регулиран DEG в млечната тъкан; (D) регулиран нагоре DEG в млечната тъкан. Размерът на възлите отразява статистическата значимост на всеки термин. По-голям размер на възела, по-малка P-стойност. Името на всяка група се дава от най-значимия термин/път на групата. Възлите са групирани по сходство на свързаните с тях гени. Възлите в шестоъгълник представляват условията на GO Cellular Component; възлите в осмоъгълника представляват условията на GO молекулярна функция; възлите в правоъгълник представлява пътя на KEGG. Малките кръгове със символи в червен шрифт представляват гените, свързани със съответните термини или пътища.