Департаментът по науки за живота и Националният институт за биотехнологии в Негев, Университет Бен Гурион в Негев, Беер Шева, 84105 Израел

диетата

Катедра по наука за преживни животни, Институт по науките за животните, Организация за селскостопански изследвания, Център за вулкани, P.O. Каре 6, Bet Dagan, 50250 Израел

Училището по екология на Портър, Тел Авивски университет, Тел Авив, 69978 Израел

Департаментът по науки за живота и Националният институт за биотехнологии в Негев, Университет Бен Гурион в Негев, Беер Шева, 84105 Израел

Катедра по наука за преживни животни, Институт по науките за животните, Организация за селскостопански изследвания, Център за вулкани, P.O. Каре 6, Bet Dagan, 50250 Израел

Училището по екология на Портър, Тел Авивски университет, Тел Авив, 69978 Израел

Департаментът по науки за живота и Националният институт за биотехнологии в Негев, Университет Бен Гурион в Негев, Беер Шева, 84105 Израел

Департаментът по науки за живота и Националният институт за биотехнологии в Негев, Университет Бен Гурион в Негев, Беер Шева, 84105 Израел

Център за биоинформатика и изчислителна биология и Катедра по компютърни науки, Университет в Тел Авив, Тел Авив, 69978 Израел

Медицинското училище Sackler, Университет в Тел Авив, Тел Авив, 69978 Израел

Училище за компютърни науки Blavatnik, Тел Авивски университет, Тел Авив, 69978 Израел

Катедра по компютърни науки и Център за биоинформатика и изчислителна биология, Университет на Мериленд, Колидж Парк, MD, 20742 САЩ

Департаментът по науки за живота и Националният институт за биотехнологии в Негев, Университет Бен Гурион в Негев, Беер Шева, 84105 Израел

Департаментът по науки за живота и Националният институт за биотехнологии в Негев, Университет Бен Гурион в Негев, Беер Шева, 84105 Израел

Катедра по наука за преживни животни, Институт по науките за животните, Организация за земеделски изследвания, Център за вулкани, P.O. Каре 6, Bet Dagan, 50250 Израел

Училището по екология на Портър, Тел Авивски университет, Тел Авив, 69978 Израел

Департаментът по науки за живота и Националният институт за биотехнологии в Негев, Университет Бен Гурион в Негев, Беер Шева, 84105 Израел

Катедра по наука за преживни животни, Институт по науките за животните, Организация за земеделски изследвания, Център за вулкани, P.O. Каре 6, Bet Dagan, 50250 Израел

Училището по екология на Портър, Тел Авивски университет, Тел Авив, 69978 Израел

Департаментът по науки за живота и Националният институт за биотехнологии в Негев, Университет Бен Гурион в Негев, Беер Шева, 84105 Израел

Департаментът по науки за живота и Националният институт за биотехнологии в Негев, Университет Бен Гурион в Негев, Беер Шева, 84105 Израел

Център за биоинформатика и изчислителна биология и Катедра по компютърни науки, Университет в Тел Авив, Тел Авив, 69978 Израел

Медицинското училище Sackler, Университет в Тел Авив, Тел Авив, 69978 Израел

Училище за компютърни науки Blavatnik, Тел Авивски университет, Тел Авив, 69978 Израел

Катедра по компютърни науки и Център за биоинформатика и изчислителна биология, Университет на Мериленд, Колидж Парк, MD, 20742 САЩ

Департаментът по науки за живота и Националният институт за биотехнологии в Негев, Университет Бен Гурион в Негев, Беер Шева, 84105 Израел

Вход за институция
Влезте в онлайн библиотеката на Wiley

Ако преди това сте получили достъп с личния си акаунт, моля, влезте.

Закупете незабавен достъп
  • Вижте статията PDF и всички свързани с нея добавки и цифри за период от 48 часа.
  • Статията не може да бъде отпечатана.
  • Статията не може да бъде изтеглена.
  • Статията не може да бъде преразпределена.
  • Неограничен преглед на PDF статията и всички свързани с нея добавки и цифри.
  • Статията не може да бъде отпечатана.
  • Статията не може да бъде изтеглена.
  • Статията не може да бъде преразпределена.
  • Неограничен преглед на статията/глава PDF и всички свързани с тях добавки и фигури.
  • Статия/глава може да бъде отпечатана.
  • Статия/глава може да се изтегли.
  • Статия/глава не могат да бъдат преразпределени.

Обобщение

Известно е, че диетичните промени влияят върху структурата на чревната общност, но остават въпроси относно механизмите, чрез които диетата предизвиква промени в членството в микробиомите. Тук разгледахме тези въпроси в екосистемата на микробиома на рубея - сложна микробна общност, която се намира в горната част на храносмилателния тракт на преживните животни и е отговорна за разграждането на погълнатия растителен материал. Нашите експерименти с диетична интервенция разкриха, че диетата засяга най-разпространените таксони в микробиома и че специфична група метаногенни археи от разред Methanomicrobiales е силно чувствителна към нейните промени. Използване на метаболомични анализи заедно с in vitro микробиологични подходи и секвениране на целия геном на Метаномикробиум мобилен, ключов вид в тази група, ние установихме, че окислително-възстановителните потенциали се променят с диетата и е основният фактор, който причинява тези диетични редувания в изобилието на тези таксони. Нашият геномен анализ предполага, че редокс потенциалният ефект произтича от намален брой антиреактивни кислородни протеини, кодирани в генома на този таксон. Нашето проучване подчертава редокс потенциала като основен фактор, който би могъл да служи като скулптурна сила на събирането на общността в анаеробните чревни микробни общности.

Допълнителна поддържаща информация може да бъде намерена в онлайн версията на тази статия на уеб сайта на издателя:

Фиг. S1. Експериментална схема за проектиране. В първия експеримент, който продължи 56 дни, четири крави бяха хранени с високозърнеста диета в продължение на 31 дни и след това бяха прехвърлени на не-зърнена диета за още 22 дни, с период на привикване от 3 дни (дни 32–34). Всяка експериментална диета се състои от различен дял от едни и същи диетични фибри във фуража. Първата диета се състои от 65% зърнени храни (високозърнеста диета), а втората от 0% зърнени храни (незърнена диета). Вторият експеримент, извършен с 5 канюлирани фризийски крави от Холщайн, продължи 69 дни и беше разделен на два периода на хранене. През първия период всички крави са били хранени с незърнеста диета в продължение на 39 дни, а през втория период, който е продължил 27 дни, три крави са били хранени с високозърнеста диета, докато две крави са останали на не-зърнена диета като контрол до края на експеримента, за да се провери дали условията на околната среда не са повлияли на резултатите от експеримента. Периодът на привикване от 3 дни (дни 40–42) даде възможност за здравословна промяна между диетите.

Фиг. S2. QPCR в реално време на общите археи и трите основни метаногенни ордена - Methanobacteriales, Methanomicrobiales и Methanosarcinales. ДНК е извлечена от проби от рубци и е предадена на qRT-PCR анализ. Контролната група се състоеше от две крави, поддържани на не-зърнена диета през целия експеримент. Експерименталната група се състоеше от три крави, хранени с различните диети, както следва: дни 1-39, без зърнени храни (светло лилав фон); дни 40‐42, период на въвеждане на нова диета (тъмно сив фон) и дни 43‐69, диета с високо съдържание на зърнени храни (светло зелено). Всеки ден представлява средната стойност на всички крави в група. The х оста представлява ден от експеримента. The Y. осите на трите горни панела представляват пропорцията на всеки метаногенен ред от общите археи. The Y. оста в долния панел представлява абсолютния археален номер на 16S rRNA копие. Изчертава се средната стойност за всяка времева точка ± SEM. Звездичките имат значителни разлики (т тест, стр