Еволюционна и геномна микробиология

Тази статия е част от изследователската тема

Последни открития в еволюционната и геномната микробиология Вижте всички 15 статии

frontiers

  • Изтеглете статия
    • Изтеглете PDF
    • ReadCube
    • EPUB
    • XML (NLM)
    • Допълнителни
      Материал
  • Цитат за износ
    • EndNote
    • Референтен мениджър
    • Прост ТЕКСТ файл
    • BibTex
СПОДЕЛИ НА

Редакционна СТАТИЯ

  • 1 Лаборатория за геномна медицина, Отдел по експериментална и клинична кардиология, Изследователски институт за сложни проблеми на сърдечно-съдовите заболявания, Кемерово, Русия
  • 2 Cancer Research UK/MRC Оксфордски институт по радиационна онкология, Отделение по онкология, Университет в Оксфорд, Оксфорд, Великобритания

Според сегашните познания човешкото тяло може да се разглежда като суперорганизъм, състоящ се от човешки клетки и резидентни микробни съобщества, наречени микробиота (Ley et al., 2008). Човешката микробиота има широк спектър от физиологични функции, играейки важна роля в храносмилането, имунитета и производството на някои витамини; повечето от тези микроорганизми обаче не могат да бъдат култивирани в лабораторни условия и доскоро това беше основното предизвикателство за ясното определяне на състава на човешкия микробиом (Tlaskalová-Hogenová et al., 2011). Нови открития в методите на молекулярната биология, включително появата на технологии omics, предоставиха възможност за дешифриране на качествения и количествен състав на микробиома (Tlaskalová-Hogenová et al., 2011). Този пробив също стимулира задълбочено изследване на взаимодействията между гостоприемника и микробиотата (Tlaskalová-Hogenová et al., 2011). Основни сравнителни изследвания разкриват, че всеки индивид има уникална микробиота, чийто състав до голяма степен се определя през първите години от живота, но може да бъде променен, обратимо или необратимо, от редица фактори, като възраст, околна среда, диета, лекарства, заболявания, и други (Zoetendal et al., 2008).

Следователно въпросът за биологията на човешкия микробиом е изключително интригуващ и през последните години са публикувани големи количества изследвания. Разследването на чревни, орални, дихателни, кожни, вагинални и пикочни микробиоми придобива нарастващ интерес и повече внимание с времето (Sommer and Bäckhed, 2013; Belkaid and Segre, 2014; Xu and Gunsolley, 2014; van de Wijgert et al., 2014; Rogers et al., 2015; Shreiner et al., 2015; Whiteside et al., 2015). Отворихме тази изследователска тема с идеята да предоставим перспектива за открития, които са се превърнали в ключови събития в тази област.

Искрено благодарим на всички изследователи, които се съгласиха да допринесат за нашата изследователска тема. Тази колекция е разделена на три раздела. Първата включва три статии, в които Ерик Баптесте, Кристофър Хаус, Матео Пелегрини и Сорел Фиц-Гибон обсъждат общите проблеми на микробната еволюция, докато Аршан Насир, Патрик Фортере, Кюнг Мо Ким и Густаво Каетано-Анолес анализират разпространението на вируси и тяхното въздействие върху еволюцията на организмите.

Последното парче от сборника е съставено от статии на други теми. Милтън Сайер и Zhongge Zhang обсъждат интригуващ принцип на насочена мутация, Рамакришнан Ситараман говори за Helicobacter pylori, ДНК метилтрансферазите и ефектът на епигенетичното поле при рака, а Антон Кутихин с колеги обобщава скорошни открития върху калцифициращи наночастици, понякога наричани нанобактерии.

Създадохме тази Изследователска тема с надеждата, че тя ще бъде полезна за широка аудитория, особено за имунолози, микробиолози, студенти и студенти от биомедицински факултети, както и техните преподаватели.

Изявление за конфликт на интереси

Авторите декларират, че изследването е проведено при липса на каквито и да било търговски или финансови отношения, които биха могли да се тълкуват като потенциален конфликт на интереси.

Препратки

Belkaid, Y. и Segre, J. A. (2014). Диалог между микробиотата на кожата и имунитета. Наука 346, 954–959. doi: 10.1126/science.1260144

Ley, R. E., Hamady, M., Lozupone, C., Turnbaugh, P. J., Ramey, R. R., Bircher, J. S., et al. (2008). Еволюция на бозайниците и техните чревни микроби. Наука 320, 1647–1651. doi: 10.1126/science.1155725

Rogers, G. B., Shaw, D., Marsh, R. L., Carroll, M. P., Serisier, D. J. и Bruce, K. D. (2015). Респираторна микробиота: адресиране на клинични въпроси, информиране на клиничната практика. Торакс 70, 74–81. doi: 10.1136/thoraxjnl-2014-205826

Shreiner, A. B., Kao, J. Y. и Young, V. B. (2015). Чревният микробиом в здравето и болестите. Curr. Становище. Гастроентерол. 31, 69–75. doi: 10.1097/MOG.0000000000000139

Sommer, F. и Bäckhed, F. (2013). Чревната микробиота - майстори на развитието на гостоприемника и физиологията. Нат. Rev. Microbiol. 11, 227–238. doi: 10.1038/nrmicro2974

Tlaskalová-Hogenová, H., Stěpánková, R., Kozáková, H., Hudcovic, T., Vannucci, L., Tučková, L., et al. (2011). Ролята на чревната микробиота (коменсални бактерии) и лигавичната бариера в патогенезата на възпалителни и автоимунни заболявания и рак: принос на безклетъчни и гнотобиотични животински модели на човешки заболявания. Клетка. Мол. Имунол. 8, 110–120. doi: 10.1038/cmi.2010.67

van de Wijgert, J. H., Borgdorff, H., Verhelst, R., Crucitti, T., Francis, S., Verstraelen, H., et al. (2014). Вагиналната микробиота: какво научихме след десетилетие на молекулярна характеристика? PLOS ONE 9: e105998. doi: 10.1371/journal.pone.0105998

Whiteside, S. A., Razvi, H., Dave, S., Reid, G. и Burton, J. P. (2015). Микробиомът на пикочните пътища - роля извън инфекцията. Нат. Преподобни Урол. 12, 81–90. doi: 10.1038/nrurol.2014.361

Xu, P. и Gunsolley, J. (2014). Приложение на метагеномиката при разбиране на здравето и заболяванията в устата. Вирулентност 5, 424–432. doi: 10.4161/viru.28532

Zoetendal, E. G., Rajilic-Stojanovic, M. и de Vos, W. M. (2008). Анализ на многообразието и функционалността на стомашно-чревния тракт. Червата 57, 1605–1615. doi: 10.1136/gut.2007.133603

Ключови думи: човешки микробиом, чревен микробиом, орален микробиом, човешка екология, еволюция, домейни на живота, човешки микобиом, ос мозък-черва-микроб

Цитиране: Kutikhin AG и Yuzhalin AE (2015) Редакция: скорошни открития в еволюционната и геномна микробиология. Отпред. Микробиол. 6: 323. doi: 10.3389/fmicb.2015.00323

Получено: 07 март 2015 г .; Приет: 31 март 2015 г .;
Публикувано: 16 април 2015 г.

Редактиран и прегледан от: John R. Battista, Университет на Луизиана и A&M College, САЩ