История на публикациите

Изгледи на статии
Altmetric
Цитати

Прегледите на статиите са съвместими с COUNTER сбор от пълни текстови изтегляния на статии от ноември 2008 г. (както PDF, така и HTML) във всички институции и лица. Тези показатели се актуализират редовно, за да отразят употребата, водеща до последните няколко дни.

Цитиранията са броят на други статии, цитиращи тази статия, изчислен от Crossref и актуализиран ежедневно. Намерете повече информация за броя на цитиранията в Crossref.

Altmetric Attention Score е количествена мярка за вниманието, което една научна статия е получила онлайн. Кликването върху иконата на поничка ще зареди страница на altmetric.com с допълнителни подробности за резултата и присъствието в социалните медии за дадената статия. Намерете повече информация за оценката на Altmetric внимание и как се изчислява резултатът.

фалшивите

Резюме

Идентификацията на метаболитите е решаваща стъпка в метаболомиката, базирана на масова спектрометрия (MS). Все още е предизвикателство да се оцени доверието на назначените метаболити. Ние съобщаваме за нов метод за оценка на степента на фалшиво откриване (FDR) на разпределянето на метаболит със стратегия за примамка, при която примамките се генерират чрез нарушаване на правилото на октета на химията чрез добавяне на малък нечетен брой водородни атоми. Стратегията за примамка към целта е интегрирана в JUMPm, автоматизиран тръбопровод за идентификация на метаболитите за мащабен анализ на MS и също е оценена с два други инструмента за метаболомика, mzMatch и MZmine 2. Надеждността на изчислението на FDR е изследвана чрез фалшиви набори от данни, които са симулиран чрез промяна на спектрите на MS1 или MS2. И накрая, използвахме конвейера JUMPm, свързан със стратегията за примамване на целта, за да обработим немаркирани и маркирани с стабилни изотопи метаболомични набори от данни. Резултатите демонстрират, че стратегията за примамка-мишена е прост и ефективен метод за оценка на доверието в идентифицирането на метаболит с висока производителност.

подкрепяща информация

Поддържащата информация е достъпна безплатно на уебсайта на публикациите на ACS на адрес DOI: 10.1021/acs.jproteome.8b00019.

Фигура S1. Оценка на стратегията за примамка с допълнителни симулационни анализи. Фигура S2. Оценка на стратегията за примамка с JUMPm, mzMatch и MZmine 2. Допълнителен текст S1. Представяне на софтуерния инструмент JUMPm. Допълнителен текст S2. Подробни процедури за тестване на mzMatch. Допълнителен текст S3. Подробни процедури за тестване на MZmine 2. (PDF)