Лесни връзки

Позовавания на статии

Обективен: Човешкото черво съдържа трилиони коменсални микроби, които живеят в хомеостаза с имунната система гостоприемник. Промени в състава и сложността на чревните микробни съобщества се наблюдават при възпалителни заболявания на червата (IBD), което показва нарушаване на взаимодействията между гостоприемника и микробите. Множество фактори, включително диета и възпалителни състояния, променят микробната сложност. Целта на това проучване е да се разработи оптимизирана методология за обработка на фекални проби и да се открият промени в чревната микробиота на пациенти с болест на Crohn, получаващи специализирани диети.

чревния

Дизайн: Фекални проби са получени от пациенти с болест на Crohn в пилотно кръстосано проучване с диета, сравняващо ефектите на специфична въглехидратна диета (SCD) спрямо диета с ниски остатъци (LRD) върху състава и сложността на чревната микробиота и разрешаването на симптомите на IBD. Съставът на чревната микробиота беше оценен с помощта на ДНК микрочип с висока плътност PhyloChip.

Резултати: Екстракцията на ДНК от фекални проби с помощта на метод, базиран на колона, осигурява последователни резултати. Сложността на чревния микробиом е по-ниска при пациенти с IBD в сравнение със здравите контроли. Повишено изобилие от Bacteroides fragilis (B. fragilis) се наблюдава във фекални проби от IBD позитивни пациенти. Временният отговор на чревния микробиом към SCD води до повишено микробно разнообразие, докато диетата LRD е свързана с намалено разнообразие на микробните общности.

Заключение: Промените в състава и сложността на чревния микробиом бяха идентифицирани в отговор на специализирана въглехидратна диета. SCD беше свързан с преструктуриране на чревните микробни общности.

Ключови думи: IBD; Болест на Крон; Фекален микробиом; Модификация на диетата; PhyloChip

Използването на пробиотици, хранителен режим и прием на различни хранителни вещества може да промени профилите на фекалната микрофлора [12, 35-37]. Специфични диети са замесени, за да играят роля при болестта на Crohn. По този начин бяха положени усилия за използване на специализирани диети, като специфична диета с въглехидрати ™ (SCD) и диета с ниско съдържание на остатъци (LRD), за възстановяване на чревния микробиом и за подобряване на здравето на червата [38-41]. SCD ограничава употребата на сложни въглехидрати и се застъпва в симптоматичното лечение на целиакия в продължение на много години след 1955 г. [42-45]. LRD е диета с ниско съдържание на фибри и служи за удължаване на времето за чревен транзит. Предполага се, че това е полезно за облекчаване на симптомите на болестта на Crohn с различни резултати [46]. Необходими са по-нататъшни изследвания, за да се добие представа за сложността и динамиката на човешката микробиота в контекста на различни диети за управление на възпаление на червата.

В това проучване изследвахме няколко метода за обработка на фекални проби за тяхната полезност при осигуряване на най-доброто представяне на разнообразието от фекални микробиоми. Целта на това проучване е да демонстрира промени в сложността на микробиома в надлъжните фекални проби след модифициране на диетата с използване на независими от културата микрочипове с висока плътност, 16S PhyloChip. Изследвахме въздействието на IBD, както и модификацията на диетата на SCD или LRD върху преструктурирането на чревната микробиота.

Това проучване е разработено отчасти за изследване на ефекта от методите за екстракция на ДНК върху способността да се откриват промени в сложността на фекалния микробиом на здрави контроли и пациенти с болестта на Crohn и да се изследват ефектите, които диетата има върху възстановяването на микробиалната сложност на червата при пациенти с болестта на Crohn. SCD и LRD са избрани, за да изследват техните ефекти върху облекчаването на клиничните симптоми на болестта на Crohn. Предишни анекдотични доклади предполагат широко използване на LRD от пациентите и потенциал за подобрено облекчаване на клиничните симптоми на болестта на Crohn с използването на SCD [47-49]. Участниците бяха записани в проучването в детските и възрастни клиники за IBD в UC Davis Medical Center (Сакраменто, Калифорния) съгласно одобрените от IRB протоколи.