• Намерете този автор в Google Scholar
  • Намерете този автор в PubMed
  • Потърсете този автор на този сайт
  • За кореспонденция: [email protected]

Редактиран от V. Ramakrishnan, Съвет за медицински изследвания, Кеймбридж, Великобритания и одобрен на 9 август 2013 г. (получено за преглед на 22 май 2013 г.)

домен

Вижте свързаното съдържание:

Модел на IF2 в пълна дължина, получен от експериментални SAXS данни. SAXS анализ на пълния IF2 (A – C) и IF2--69 (D – F). (A и D) Рентгеново разсейване (сини точки) и крива на разсейване, изчислени от DADIMODO усъвършенстваните модели (червена крива). (Вмъкване) сюжет на Guinier. (B и E) Ab initio пликове, изчислени с DAMMIF. (C и E) Представителни модели SAXS, получени след усъвършенстване на твърдо тяло DADIMODO, насложено върху плика ab initio. (F) Сравнение на SAXS-моделите, получени за естествени IF2 и IF2-Δ69.

Крио-ЕМ структура на IF2, свързана в 30S и 70S ICs. (A) Структура на 30S IC комплекс с монтирания модел; Посочени са IF1, IF2 и fMet-tRNA fMet. (B) Сегментиран регион на 30S IC, показващ относителното положение на IF2 домейните, тРНК пътя и анти-Shine-Dalgarno региона. (Долна) Илюстрация на конформационния превключвател на домейн С1 между кристалната структура на изолирания апо-IF2 (3-467) (12) и 30S-свързания фактор. (C) Цялостна архитектура на IF2, получена от крио-ЕМ структурата на 30S IC и наличните кристални структури на IF2 [1–363 (11); 3–467 (12)] и NMR структурата на С2 домейна (19), която не се вижда в кристалната структура IF2 (3–467), осигуряваща модел на IF2 с равна на молекулярна механика (MM) с пълна дължина. (Вмъкване) Ъгъл на гледане на 30S IC. (D) Сравнение на 30S ICs с естествени IF2 и IF2-Δ69. (E и F) Сравнение на 30S IC с див тип (WT) IF2 и 70S IC с IF2-Δ69.

N домейнът е необходим за стабилно присъединяване на рибозомната субединица. (A) IF2-Δ69 показва активност на присъединяване на субединицата, намалена с 50% в сравнение с WT IF2, както се наблюдава чрез експерименти с разсейване на светлина. (B) Образуване на дипептид на IC 70S. (C – F) Едномолекулна субединица, присъединяваща се към експерименти с пълна дължина или пресечен T. thermophilus IF2-6969, E. coli IF2α и E. coli IF2β; лентите за грешки представляват SD. В С, всички 50S свързващи събития бяха монтирани, докато в D само най-дългото събитие за всяка молекула беше избрано за напасване. Честотите на 50S свързващи събития се изчисляват от броя на събитията на следа, разделен на общото време на експеримента (E). (F) Време на изчакване от доставката на 50S до появата на първото събитие за пристигане 50S.