ICB Институт по компютърна биология

  • За нас
  • Персонал
    • Възпитаници
  • Управление
  • Финансиране от трети страни
    • Текущи проекти
    • Готови проекти
  • Семинар по компютърно здраве
    • Минали семинари
  • Групи
    • Theis Lab
    • Marr Lab
    • Лаборатория Хайниг
    • Лаборатория Hasenauer
    • Лаборатория Fuchs
    • Лаборатория Крумсиек
    • Лаборатория на Н. Мюлер
    • Лаборатория Коломе-Таче
    • Scialdone Lab
    • Лаборатория Ахмиди
    • Лаборатория Менден
    • Лаборатория Шуберт
    • Лаборатория Marsico
    • C.L. Лаборатория Мюлер
    • Лаборатория Gagneur
    • Лаборатория Kastenmüller
    • Лаборатория Knauer-Arloth
    • Jüstel Lab
  • Зимни курсове 2020/2021
    • Магистър по биоинформатика Практически SS19
    • Изчислителни методи за едноклетъчна биология, лекции и работа по проекти
  • Курсове
    • Теми по компютърна биология WS19/20
    • Магистър по биоинформатика Практически SS20
    • Въведение в анализ на данни за секвениране на едноклетъчна РНК със сканиране
  • Университетски принадлежности
  • Проекти за отворени дисертации
  • Новини
  • Указания
  • Статистическо консултиране на основните съоръжения
  • Работни места
  • Бакалавър/магистър @ ICB
  • Студентски работни места

Проф. Д-р д-р Фабиан Теис
Ръководител на ръководител на института и изследователската група

анализ данни

Телефон: +49 89 3187-43260
Електронна поща
Сграда/стая: 58а/112

Автобиография

От май 2013 г. Фабиан Тейс е директор на Института по изчислителна биология към Helmholtz Zentrum München и заема катедра „Математическо моделиране на биологични системи“ в Департамента по математика на ТУ Мюнхен. От 2019 г. е асоцииран факултет в Wellcome Trust Sanger Institute в Hinxton, Великобритания. Неговите изследователски интереси включват разработване на изчислителни методи за анализ и моделиране на едноклетъчни хетерогенности, както и машинно и дълбоко обучение за прогнозиране в биологията и биомедицината. През 2017 г. той бе награден с наградата Erwin Schrödinger заедно в интердисциплинарен екип в ETH Zürich. Fabian Theis е част от и също така координира различни консорциуми (т.е. sparse2big с участието на 8 центъра на Хелмхолц) и основава мрежата SingleCellOmics Германия (SCOG). Фабиан Теис координира стартиралото през 2019 г. Мюнхенско училище за наука за данни (MUDS) и е научен директор на звеното за сътрудничество за изкуствен интелект Helmholtz (Helmholtz AI)

Избрани публикации

1. Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf F.A., Theis, F.J. Генерализиране на скоростта на РНК до преходни клетъчни състояния чрез динамично моделиране. Природна биотехнология. doi: 10.1038/s41587-020-0591-3 (2020).

2. Böttcher, A, Büttner, M, Tritschler, S, [. ], Theis, FJ °, Ликерт, Н °. Чревните стволови клетки с Wnt/PCP директно се диференцират в ентероендокринни или Paneth клетки. приети в Nature Cell Biology (2020)

3. Sachs S, Bastidas-Ponce, A, Tritschler, S, [. ]., Tschöp, MH, Theis, FJ °, Hofmann, SM °, Müller, TD °, Lickert, H °. Насочената фармакологична терапия възстановява функцията на β-клетките за ремисия на диабета. Природен метаболизъм 2, 192–209 (2020)

4. Lotfollahi, M, Wolf, FA и Theis, FJ. scGen предсказва едноклетъчни реакции на смущения. Nature Methods 16, 715–721 (2019)

5. Fischer, DS, Fiedler, AK, Kernfeld, E, Genga, RM, Hasenauer, J, Maehr, R., Theis, FJ. Извеждане на динамика на популацията от данни от времеви редове за едноклетъчно РНК-секвениране Nature Biotechnology 37, 461–468 (2019)

6. Buettner, M, Miao, Z, Wolf, FA, Teichmann, SA °, Theis, FJ °. Тестова метрика за оценка на едноклетъчна РНК-последователна корекция на партиди. Nature Methods 19, 43–49 (2019)

7. Eraslan, G, Simon, L, Mircea, M, Mueller, NS, Theis, FJ. Отделяне на едноклетъчна РНК-секвенция, използвайки автокодер с дълбоко броене. Nature Communications 10, 390 (2019)

8. Вълк, Ж, Ангерер, П, Theis, FJ. SCANPY: Мащабен анализ на данни за едноклетъчна генна експресия. Биология на генома 19, 15 (2019). (класиран сред най-цитираните статии тази година от Gen Biol)

9. Buggenthin, F, Buettner, F, Hoppe, PS, Endele, M, Kroiss, M, Strasser, M, Schwarzfischer, M, Loeffler, D, Kokkaliaris, KD, Hilsenbeck, O, Schroeder, T °, Theis, FJ°, Marr, C °. Проспективно идентифициране на избора на кръвотворна линия чрез задълбочено обучение. Природни методи 14 403–406 (2017)

10. Haghverdi, L, Buettner, M, Wolf FA, Buettner F, Theis FJ. Дифузионното псевдочасто реконструира разклоняване на родословната линия. Nature Methods 13, 845–848 (2016)